More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2185 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
337 aa  681    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  63.02 
 
 
353 aa  425  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 
338 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  57.93 
 
 
333 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  47.46 
 
 
338 aa  309  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  40.06 
 
 
386 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
325 aa  179  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
325 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
325 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
325 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 
325 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  35.31 
 
 
325 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.07 
 
 
231 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.38 
 
 
231 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.13 
 
 
231 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.6 
 
 
231 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 
330 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.22 
 
 
230 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.98 
 
 
231 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.74 
 
 
231 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.4 
 
 
230 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
344 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.95 
 
 
239 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.21 
 
 
230 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.15 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.44 
 
 
232 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.15 
 
 
236 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.15 
 
 
236 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.16 
 
 
225 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
288 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 
288 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
300 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
288 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  30.79 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  26.43 
 
 
306 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
287 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 
287 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  31.33 
 
 
282 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  30.35 
 
 
284 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 
325 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
281 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
292 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.35 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 
283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
294 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 
285 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.55 
 
 
286 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
284 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  27.99 
 
 
293 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
282 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
293 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
281 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
285 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
286 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
285 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
296 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 
284 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
281 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
284 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
285 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
284 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
281 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 
287 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  31.23 
 
 
295 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
283 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
283 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>