217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2111 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 
1408 aa  2862    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  40.66 
 
 
1428 aa  936    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  28.25 
 
 
1457 aa  155  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  29.61 
 
 
1403 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  30.04 
 
 
606 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  29.31 
 
 
1427 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  27.48 
 
 
1255 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.57 
 
 
1271 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  25.31 
 
 
1261 aa  135  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  27.59 
 
 
1275 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  27.75 
 
 
1259 aa  112  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  27.78 
 
 
934 aa  108  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.72 
 
 
759 aa  105  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  30.86 
 
 
902 aa  105  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.17 
 
 
797 aa  105  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.38 
 
 
986 aa  104  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  26.96 
 
 
1090 aa  103  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.28 
 
 
769 aa  103  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.28 
 
 
759 aa  102  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.54 
 
 
759 aa  102  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.54 
 
 
759 aa  102  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.11 
 
 
759 aa  102  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.53 
 
 
902 aa  102  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.32 
 
 
759 aa  102  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.95 
 
 
1077 aa  101  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.11 
 
 
759 aa  101  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.78 
 
 
759 aa  101  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.54 
 
 
769 aa  100  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.79 
 
 
629 aa  100  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.06 
 
 
759 aa  98.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.59 
 
 
1048 aa  95.5  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  29.27 
 
 
1097 aa  95.1  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.96 
 
 
752 aa  94  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.18 
 
 
1116 aa  92.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.74 
 
 
636 aa  91.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.22 
 
 
633 aa  89  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.49 
 
 
716 aa  88.6  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.76 
 
 
1118 aa  86.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  28.04 
 
 
643 aa  85.9  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.67 
 
 
901 aa  85.9  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.8 
 
 
925 aa  85.1  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  31.25 
 
 
1041 aa  85.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.97 
 
 
632 aa  84.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.22 
 
 
635 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.36 
 
 
636 aa  84.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.5 
 
 
585 aa  82.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  23.97 
 
 
1126 aa  82.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.67 
 
 
651 aa  81.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.09 
 
 
1099 aa  80.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  23.05 
 
 
1284 aa  80.1  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  29.78 
 
 
650 aa  80.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  30.24 
 
 
609 aa  80.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.99 
 
 
611 aa  79.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  28.07 
 
 
655 aa  79.3  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  29.78 
 
 
650 aa  79  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.69 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.84 
 
 
633 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.67 
 
 
633 aa  77.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  26.87 
 
 
315 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.27 
 
 
466 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
1190 aa  76.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  27.03 
 
 
1018 aa  76.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  26.21 
 
 
914 aa  76.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  23.64 
 
 
1139 aa  75.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.33 
 
 
619 aa  75.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  28.16 
 
 
1622 aa  75.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.78 
 
 
952 aa  73.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.18 
 
 
1189 aa  74.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  26.69 
 
 
1335 aa  74.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.47 
 
 
1653 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.09 
 
 
1999 aa  73.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.99 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.08 
 
 
928 aa  73.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  23.28 
 
 
1172 aa  73.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  28.42 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.99 
 
 
633 aa  73.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.7 
 
 
1163 aa  72.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 
2310 aa  72  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  29.66 
 
 
1185 aa  72  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  25.7 
 
 
1228 aa  71.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.74 
 
 
1111 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.18 
 
 
932 aa  70.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.35 
 
 
1038 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.25 
 
 
388 aa  70.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.04 
 
 
1620 aa  68.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.55 
 
 
1585 aa  68.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.55 
 
 
1585 aa  68.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.32 
 
 
941 aa  67.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.35 
 
 
754 aa  67  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.47 
 
 
1250 aa  67  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  22.34 
 
 
916 aa  66.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.24 
 
 
486 aa  66.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  22.57 
 
 
922 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  27.94 
 
 
1108 aa  65.9  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.23 
 
 
795 aa  65.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  22.95 
 
 
715 aa  65.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  22.7 
 
 
2245 aa  65.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  26.58 
 
 
904 aa  65.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  23.98 
 
 
1350 aa  63.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  23.61 
 
 
1143 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>