189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8333 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 118 aa  226  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  57 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  61.39 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  61.17 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  57.84 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  62.79 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  54.21 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  55.21 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  47.86 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  52.38 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  40.43 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 263 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  44.32 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  42.22 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  42.22 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  41.11 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  43.18 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  47.78 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  42.22 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  41.11 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  42.22 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  42.53 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  37.23 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  46.88 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  34.78 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  37.23 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  45.98 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  35.79 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  39.56 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  40.4 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  34.41 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  40.78 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  46.38 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  35 
 
 		 250 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 220 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>