63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6579 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6579  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 457 aa  896    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5438  hypothetical protein  31.22 
 
 		 293 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  29.28 
 
 		 934 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 		 1158 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 946 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 1048 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0806  hypothetical protein  26.32 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0965  hypothetical protein  26.32 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  43.02 
 
 		 1058 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.16 
 
 		 1004 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  29.32 
 
 		 1005 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  25.46 
 
 		 252 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  28.34 
 
 		 1010 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 1193 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  32.72 
 
 		 1102 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  28.81 
 
 		 1017 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2743  hypothetical protein  23.01 
 
 		 278 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 940 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.23 
 
 		 631 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.12 
 
 		 1021 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.53 
 
 		 1054 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  30 
 
 		 268 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 969 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  26.53 
 
 		 993 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  28.3 
 
 		 370 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.35 
 
 		 1100 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  29.53 
 
 		 1033 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 1043 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0794  hypothetical protein  25.48 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00331983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  31.33 
 
 		 1118 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 1033 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  29.27 
 
 		 1090 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  27.85 
 
 		 994 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  31.1 
 
 		 885 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  30.48 
 
 		 957 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32 
 
 		 1150 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.7 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  29.49 
 
 		 1733 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  30.69 
 
 		 1103 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.49 
 
 		 919 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  28.21 
 
 		 935 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  31.17 
 
 		 611 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  28.06 
 
 		 1093 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  32.08 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 1186 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  26.42 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  27.57 
 
 		 954 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 1346 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2612  hypothetical protein  22 
 
 		 282 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  49.06 
 
 		 1056 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.76 
 
 		 1067 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  25.1 
 
 		 597 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.54 
 
 		 1121 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  28.97 
 
 		 1022 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 602 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  27.51 
 
 		 981 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1282  hypothetical protein  22 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.03 
 
 		 1110 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>