More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00670 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00670  pseudouridylate synthase, putative  100 
 
 		 514 aa  1057    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84338  pseudouridine synthase  35.16 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188482  normal  0.052244 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03170  pseudouridylate synthase 3 (AFU_orthologue; AFUA_3G13350)  34.75 
 
 		 664 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_3550  predicted protein  37.03 
 
 		 257 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658668  normal  0.123693 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5217  predicted protein  32.01 
 
 		 216 aa  144  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28572  predicted protein  28.66 
 
 		 286 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0301527  hitchhiker  0.000000212396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  27.24 
 
 		 267 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  25.87 
 
 		 264 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  31.28 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  30.6 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  28.11 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  25.83 
 
 		 271 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  30.98 
 
 		 263 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  30.05 
 
 		 285 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2938  tRNA pseudouridine synthase A  26.44 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  28.96 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1528  tRNA pseudouridine synthase A  25.23 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13492  tRNA pseudouridine synthase A  28.8 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.39431  normal  0.20778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  31.55 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  31.17 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  29.17 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2653  tRNA pseudouridine synthase A  26.93 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  27.55 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1555  tRNA pseudouridine synthase A  30.05 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  27.5 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3767  tRNA pseudouridine synthase A  25.39 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 271 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  24.46 
 
 		 271 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  27.89 
 
 		 271 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  26.56 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  25.52 
 
 		 255 aa  72  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4284  tRNA pseudouridine synthase A  28.57 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143987  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1144  tRNA pseudouridine synthase A  28.5 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1115  tRNA pseudouridine synthase A  28.5 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  27.62 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1132  tRNA pseudouridine synthase A  28.5 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  25.64 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  25.93 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  27.37 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  26.23 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  25.58 
 
 		 289 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3893  tRNA-pseudouridine synthase I  29.71 
 
 		 276 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  25.61 
 
 		 250 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17251  tRNA pseudouridine synthase A  33.77 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1217  tRNA pseudouridine synthase A  27.84 
 
 		 278 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  30.81 
 
 		 245 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  31.58 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12020  pseudouridylate synthase I  27.46 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1416  tRNA pseudouridine synthase A  24.52 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2301  tRNA pseudouridine synthase ACD  25.93 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  26.78 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  25.25 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0966  tRNA pseudouridine synthase A  29.73 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.982634  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.22 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  26.76 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  26.85 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  26.76 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  30.67 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  31.82 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  26.76 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  27.03 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  29.29 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  29.67 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  27.37 
 
 		 267 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  26.37 
 
 		 261 aa  67  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  26.76 
 
 		 270 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  26.87 
 
 		 283 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2800  tRNA pseudouridine synthase A  26.87 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  27.09 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  27.09 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  27.09 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  29.89 
 
 		 274 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  27.09 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29400  pseudouridylate synthase I  24.3 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0336  tRNA pseudouridine synthase A  30.56 
 
 		 297 aa  66.6  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0521282  decreased coverage  0.000493402 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  27.09 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4288  tRNA pseudouridine synthase A  28.18 
 
 		 288 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.620065  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  22.95 
 
 		 246 aa  66.6  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  27.87 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34220  tRNA pseudouridine synthase A  29.89 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823963  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0770  tRNA pseudouridine synthase A  24.41 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  30.72 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  22.64 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  25.74 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3817  tRNA pseudouridine synthase A  28.96 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2620  tRNA pseudouridine synthase A  27.78 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  25.82 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  26.42 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  26.42 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>