More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA01120 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1155    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  43.16 
 
 
606 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  43.16 
 
 
606 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  40.75 
 
 
490 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  40.29 
 
 
532 aa  350  4e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  38.81 
 
 
623 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.91072 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  37.64 
 
 
559 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  38.46 
 
 
572 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 
521 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  37.14 
 
 
552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  38.26 
 
 
462 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  33.25 
 
 
524 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.14 
 
 
511 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.46 
 
 
1021 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.41 
 
 
510 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.98 
 
 
620 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 
838 aa  143  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  30.07 
 
 
836 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.1 
 
 
1891 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  29.35 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  28.6 
 
 
814 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 
703 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 
742 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 
588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  28.18 
 
 
574 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.4 
 
 
642 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.93 
 
 
885 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  25.1 
 
 
752 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  27.36 
 
 
1005 aa  127  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.91 
 
 
593 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  28.74 
 
 
739 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.94 
 
 
1855 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  28.03 
 
 
649 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.71 
 
 
599 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  25.34 
 
 
622 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 
1017 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.11 
 
 
604 aa  118  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  24.21 
 
 
2638 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  29.15 
 
 
925 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.61 
 
 
1942 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.63 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.19 
 
 
1975 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 
587 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 
600 aa  114  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.42 
 
 
484 aa  111  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 
609 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 
624 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  26.4 
 
 
575 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  26.93 
 
 
635 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  25.39 
 
 
584 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 
767 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
614 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 
571 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.36 
 
 
582 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  25.12 
 
 
586 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.14 
 
 
2068 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.7 
 
 
586 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  23.7 
 
 
586 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.7 
 
 
586 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  22.88 
 
 
586 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.7 
 
 
586 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  25.05 
 
 
564 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 
486 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 
528 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 
622 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  23.49 
 
 
762 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.44 
 
 
586 aa  98.2  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  28.29 
 
 
687 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.81 
 
 
610 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25.4 
 
 
528 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  28.29 
 
 
687 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  28.29 
 
 
687 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  22.89 
 
 
610 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  21.42 
 
 
499 aa  97.8  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.52 
 
 
610 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  24.82 
 
 
723 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  25.35 
 
 
533 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  27.03 
 
 
646 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  26.77 
 
 
553 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.56 
 
 
586 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  25.06 
 
 
686 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.3 
 
 
586 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.96 
 
 
586 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  23.66 
 
 
586 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  24.4 
 
 
690 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.13 
 
 
477 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.15 
 
 
589 aa  92.8  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  23.89 
 
 
686 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  25.28 
 
 
509 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  28.62 
 
 
676 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 
562 aa  92  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 
578 aa  92  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.88 
 
 
541 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  28.22 
 
 
694 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  23.74 
 
 
617 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  27.49 
 
 
676 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  26.42 
 
 
549 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  26.42 
 
 
549 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  21.63 
 
 
576 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  26.64 
 
 
676 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>