More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2809 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  60.21 
 
 		 1055 aa  1287    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  44.24 
 
 		 1048 aa  858    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  44.13 
 
 		 1036 aa  855    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  43.69 
 
 		 1058 aa  872    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1059 aa  911    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  100 
 
 		 1050 aa  2093    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  60.15 
 
 		 1040 aa  1222    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  42.28 
 
 		 1058 aa  855    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  56 
 
 		 1039 aa  1153    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  46.5 
 
 		 1063 aa  924    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  48.71 
 
 		 1049 aa  918    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  45.24 
 
 		 1041 aa  892    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  44.31 
 
 		 1046 aa  838    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  44.84 
 
 		 1034 aa  886    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  44.8 
 
 		 1053 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1050 aa  598  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.4 
 
 		 1034 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1043 aa  588  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1058 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1038 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1028 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1039 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.6 
 
 		 1011 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1470 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1028 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.15 
 
 		 1496 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1028 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.62 
 
 		 1024 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1055 aa  556  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1071 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1044 aa  549  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1032 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1033 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1177 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1101 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1095 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1047 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1044 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1171 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1064 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1051 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 		 1070 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.85 
 
 		 1069 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1043 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1065 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1054 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.05 
 
 		 1023 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1036 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1034 aa  522  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1054 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1028 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1054 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1062 aa  506  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1066 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  31.98 
 
 		 1026 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.86 
 
 		 1049 aa  500  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.2 
 
 		 1024 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1067 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1022 aa  499  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 		 1031 aa  498  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  31.68 
 
 		 1035 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1024 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1045 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1038 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1022 aa  492  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1040 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1035 aa  489  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1023 aa  488  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1075 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1040 aa  485  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1044 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1027 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1009 aa  481  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1046 aa  482  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1073 aa  479  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1031 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1029 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1046 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1025 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1031 aa  469  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1051 aa  469  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1044 aa  465  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1036 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1031 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1042 aa  462  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1037 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1044 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1044 aa  462  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1031 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1030 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  30.71 
 
 		 1013 aa  458  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.48 
 
 		 1022 aa  459  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1048 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1041 aa  459  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1048 aa  455  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1031 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>