More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1132 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 352 aa  710    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  66.76 
 
 		 354 aa  497  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  66.76 
 
 		 353 aa  497  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  66.01 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  66.38 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  65.44 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  65.72 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  64.87 
 
 		 354 aa  461  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  65.62 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  52.59 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  36.68 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  32.54 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  32.56 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.31 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.09 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  35.42 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  34.55 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  32.38 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  37.24 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.32 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.77 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  34.78 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  37.63 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  35.36 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.6 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.81 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.6 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.85 
 
 		 299 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.69 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  32.98 
 
 		 302 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.23 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.85 
 
 		 301 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 305 aa  96.7  6e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  37.1 
 
 		 304 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.38 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  25.36 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  35.29 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.48 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  29.24 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.28 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  30.57 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  36.87 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  29.24 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  35.75 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  35.75 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.81 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.11 
 
 		 294 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.81 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  35.79 
 
 		 300 aa  94  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  38.67 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 299 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  33.16 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  34.64 
 
 		 365 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  34.64 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  32.43 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  37.89 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  34.95 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.81 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.29 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.29 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.97 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  34.83 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  32.99 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  32.06 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  33.16 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  32.04 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  32.42 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  31.88 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  34.2 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  35.53 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  36.67 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.77 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.77 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  27.4 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.68 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  37.18 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  33.16 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  30.74 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  33.16 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  32.79 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  34.03 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  31.08 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>