More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0701 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0701  putative Na+/solute symporter  100 
 
 		 438 aa  850    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  30.26 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.87 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.86 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.41 
 
 		 484 aa  99.8  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.65 
 
 		 487 aa  97.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.66 
 
 		 461 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  24.7 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  21.9 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.18 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.5 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.66 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.76 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  27.61 
 
 		 490 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  24.11 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.27 
 
 		 460 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.27 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  25.85 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25.85 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.21 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  24.11 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  23.22 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.5 
 
 		 483 aa  79.7  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  23.52 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.07 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.17 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  22.14 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  26.91 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  27.54 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  24.36 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  24.74 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  25 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  25.21 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  23.75 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  26.15 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.2 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  28.91 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  24.52 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  24.52 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.93 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  24.52 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  24.24 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  23.12 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.93 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  24.24 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  24.46 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  24.46 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  24.46 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25.21 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  24.29 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  25.07 
 
 		 633 aa  73.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  25 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  24.6 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  25 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  22.8 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  26.12 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  26.18 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.17 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  25.72 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 638 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  24.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.22 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  23.18 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  27.49 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  23.61 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.01 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  26.61 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0769  Na+/solute symporter  24.79 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  24.75 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  22.89 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25.67 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  22.31 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.75 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.79 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  24.53 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  29.83 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.78 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  26.78 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.14 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2974  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.65 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  25.29 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>