84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0639 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  770    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.34085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1951  hypothetical protein  41.29 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00148546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0145  TPR repeat-containing protein  38.34 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.116417  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1307  hypothetical protein  33.06 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.181406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 427 aa  166  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0925  conserved hypothetical protein, putative ATP-dependent nuclease  30.12 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0605  putative lipoprotein  30.29 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0518  putative lipoprotein  30.29 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1437  putative lipoprotein  29.49 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  43.86 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  30.77 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  39.68 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 566 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 566 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 592 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 573 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  43.86 
 
 		 610 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  36.14 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  35.37 
 
 		 583 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.86 
 
 		 610 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 579 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 568 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 617 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  33.73 
 
 		 592 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.71 
 
 		 573 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  36.14 
 
 		 593 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.53 
 
 		 594 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 572 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 642 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.31 
 
 		 599 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 722 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  34.92 
 
 		 621 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  34.92 
 
 		 621 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  36.07 
 
 		 566 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 567 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 621 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 599 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  26.8 
 
 		 572 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  34.12 
 
 		 559 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 559 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 562 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 576 aa  47  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 616 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.31 
 
 		 548 aa  46.6  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 592 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 609 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 585 aa  46.6  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 642 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 		 645 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  44.68 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  31.88 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  36.54 
 
 		 620 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.38 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.55 
 
 		 619 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 595 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  25.36 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  38.46 
 
 		 616 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  30.12 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  36.23 
 
 		 573 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 581 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 582 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 575 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 573 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  27.35 
 
 		 594 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  27.59 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 584 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  36.54 
 
 		 635 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 573 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.68 
 
 		 563 aa  42.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>