244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0634 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  69.05 
 
 		 187 aa  257  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  59.39 
 
 		 187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  56.89 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  46.7 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  47.4 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  44.51 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  46.51 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  47.27 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  49.32 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  39.89 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  40.94 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  43.67 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  41.82 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  39.89 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  37.57 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  39.26 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  36.46 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  39.89 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  42.01 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  38.92 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  43.21 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.51 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  40.7 
 
 		 189 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  44.17 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  39.87 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  42.17 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  39.23 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  40 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  38.67 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  41.76 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  39.52 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  40.54 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  39.88 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  42.77 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  42.29 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  41.3 
 
 		 180 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  39.02 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  36.93 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  40.32 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  39.67 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  39.08 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  38.75 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  39.64 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  40.11 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  40.11 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  40.11 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  38.59 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  41.76 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  39.58 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  37.14 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  36.81 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  35.56 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  41.14 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  35.56 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  39.63 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  35.56 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  35.8 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  35.56 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  45.45 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  36.57 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  36.84 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  35.75 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  35.75 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  35.75 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  38.2 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  40.82 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  38.41 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  38.33 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  37.04 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  37.35 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  37.21 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  40.45 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  36.56 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  36.61 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  37.82 
 
 		 249 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  36.94 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  38.61 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  38.61 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  37.28 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  42.51 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  33.94 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  36.88 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  36.36 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  40.23 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  36.88 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  39.74 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  36.75 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  32.79 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  35.62 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  35.11 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  35.56 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  35.52 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  33.12 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  34.81 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>