More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0502 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0502  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 237 aa  473  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0108614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  48.44 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.85 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  47.68 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  43.7 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.38 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  46.7 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.29 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  40.51 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.29 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  40.51 
 
 		 236 aa  191  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  45.41 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  40.09 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.71 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  43.16 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  44.64 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  45.07 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  44.39 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  42.31 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  41.95 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  39.83 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  41.88 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.59 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  44.2 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.44 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  44.19 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  44.13 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  40.93 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  43.04 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  44.13 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  41.45 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  41.28 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.12 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  44.54 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.02 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  44.13 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  44.74 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  44.74 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  44.13 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.01 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  45.3 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4997  ABC transporter related  43.28 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  42.25 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  43.72 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  41.48 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  43.83 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.6 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.62 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  44.13 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  44.16 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  41.67 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  41.55 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  41.59 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  43.22 
 
 		 739 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  40.72 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  40.55 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.25 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.47 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  41.03 
 
 		 254 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  42.13 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  42.92 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  40 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  40.74 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  41.63 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.77 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5243  ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  39.24 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  40.77 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  39.83 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  43.48 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.05 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  47.12 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  41.4 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  41.82 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  41.56 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  42.31 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  42.4 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.93 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>