More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4538 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  100 
 
 		 498 aa  958    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  76.08 
 
 		 502 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  78.72 
 
 		 497 aa  691    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.59 
 
 		 482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.98 
 
 		 496 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.39 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.5 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.29 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  53.75 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.21 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.92 
 
 		 543 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.11 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.96 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.59 
 
 		 537 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 517 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 		 558 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 529 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 		 537 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  26.98 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 501 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.48 
 
 		 635 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 482 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.7 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.44 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.51 
 
 		 561 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.65 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.7 
 
 		 530 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.88 
 
 		 564 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.28 
 
 		 515 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.23 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2586  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941296  hitchhiker  0.00272882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.84 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.07 
 
 		 513 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.55 
 
 		 492 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 		 559 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.02 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.81 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.93 
 
 		 570 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.51 
 
 		 492 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  25.34 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 489 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.6 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 519 aa  153  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 		 578 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.16 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.59 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.59 
 
 		 599 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.27 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  25.28 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  26.35 
 
 		 599 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.27 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 		 599 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  26.35 
 
 		 599 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 		 599 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.59 
 
 		 599 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.35 
 
 		 599 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.3 
 
 		 597 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.61 
 
 		 519 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 579 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 		 599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.83 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 		 539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 		 490 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.38 
 
 		 526 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.39 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.65 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.21 
 
 		 524 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 		 511 aa  146  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 479 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.85 
 
 		 541 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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