More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0166 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  67.78 
 
 		 795 aa  1048    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  52.48 
 
 		 771 aa  796    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  69.08 
 
 		 772 aa  1070    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  50 
 
 		 766 aa  781    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 789 aa  1611    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  52.16 
 
 		 773 aa  798    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  49.81 
 
 		 771 aa  763    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  52.16 
 
 		 773 aa  799    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  88.24 
 
 		 789 aa  1415    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  79.13 
 
 		 775 aa  1248    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  36.39 
 
 		 711 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  33.44 
 
 		 672 aa  324  5e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  33.74 
 
 		 655 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.09 
 
 		 698 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  29.31 
 
 		 686 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  30.54 
 
 		 668 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  29.89 
 
 		 677 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  31.05 
 
 		 680 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  26.47 
 
 		 640 aa  198  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  29.76 
 
 		 731 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  29.03 
 
 		 676 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  29.88 
 
 		 680 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  29.88 
 
 		 573 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  28.74 
 
 		 753 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  29.44 
 
 		 550 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  25.44 
 
 		 744 aa  105  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  34.57 
 
 		 725 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 662 aa  100  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  36.82 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.69 
 
 		 739 aa  100  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.42 
 
 		 763 aa  99  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  41.67 
 
 		 580 aa  99  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 		 749 aa  98.6  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  37.5 
 
 		 578 aa  98.6  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  40.91 
 
 		 569 aa  98.6  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  42.18 
 
 		 653 aa  98.2  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  42.18 
 
 		 657 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  39.29 
 
 		 570 aa  97.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  42.67 
 
 		 665 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.05 
 
 		 754 aa  95.9  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  26.57 
 
 		 691 aa  95.5  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  40.91 
 
 		 787 aa  95.5  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  27.29 
 
 		 810 aa  94.7  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.06 
 
 		 740 aa  95.1  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.57 
 
 		 756 aa  94.7  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.23 
 
 		 727 aa  94.7  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.05 
 
 		 806 aa  94.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  42.11 
 
 		 656 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 810 aa  92.8  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.75 
 
 		 570 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.03 
 
 		 738 aa  93.2  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.25 
 
 		 742 aa  92.8  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  35.95 
 
 		 570 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.16 
 
 		 639 aa  93.2  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.31 
 
 		 704 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.46 
 
 		 1085 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  39.02 
 
 		 634 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  40.74 
 
 		 656 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  26.96 
 
 		 699 aa  92.8  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  35.95 
 
 		 570 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  28.44 
 
 		 763 aa  92.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.64 
 
 		 754 aa  92  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  41.94 
 
 		 305 aa  92.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.11 
 
 		 754 aa  92.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  37.88 
 
 		 442 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.27 
 
 		 755 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.18 
 
 		 757 aa  92  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  29.85 
 
 		 466 aa  91.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.88 
 
 		 742 aa  91.7  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  32.98 
 
 		 646 aa  91.3  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  26.62 
 
 		 713 aa  90.5  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.82 
 
 		 743 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  36.73 
 
 		 697 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  29.01 
 
 		 764 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.5 
 
 		 805 aa  90.1  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  41.48 
 
 		 652 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  26.09 
 
 		 703 aa  89  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  38.24 
 
 		 450 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 682 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 450 aa  89  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  27.31 
 
 		 814 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  36.3 
 
 		 450 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.99 
 
 		 773 aa  88.2  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.39 
 
 		 740 aa  87.8  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.6 
 
 		 299 aa  87.8  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  36.99 
 
 		 577 aa  87.8  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.05 
 
 		 754 aa  87.8  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.13 
 
 		 759 aa  87.8  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  37.6 
 
 		 434 aa  87.8  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  35.92 
 
 		 448 aa  87.4  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.82 
 
 		 801 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5461  AAA ATPase, central region  26.37 
 
 		 577 aa  87.4  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0120801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  40.65 
 
 		 687 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  24.88 
 
 		 646 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  39.84 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  24.94 
 
 		 754 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  28.34 
 
 		 806 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  36.11 
 
 		 680 aa  86.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  27.03 
 
 		 722 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.7 
 
 		 719 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>