244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1485 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
327 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  87 
 
 
332 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  88.54 
 
 
332 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  73.7 
 
 
329 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  73.7 
 
 
329 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  73.7 
 
 
329 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  73.7 
 
 
329 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  73.39 
 
 
329 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  73.39 
 
 
329 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  73.39 
 
 
329 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  72.78 
 
 
324 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  73.09 
 
 
325 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  72.78 
 
 
324 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  72.78 
 
 
324 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  72.78 
 
 
324 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  72.48 
 
 
324 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  72.48 
 
 
324 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  48.91 
 
 
324 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  50.15 
 
 
324 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  48.01 
 
 
331 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  48.26 
 
 
326 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  47.6 
 
 
320 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  47.24 
 
 
328 aa  315  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  50.76 
 
 
324 aa  309  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  49.85 
 
 
324 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  47.95 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  49.06 
 
 
324 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  47.09 
 
 
331 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  49.38 
 
 
324 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  46.97 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  46.67 
 
 
332 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  39.21 
 
 
323 aa  255  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  42.71 
 
 
308 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  38.59 
 
 
324 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  37.9 
 
 
374 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  34.67 
 
 
297 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  31.85 
 
 
402 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  32.49 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.1 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.19 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  35.37 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  25.59 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  27.12 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.8 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  30.38 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  33.16 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  35.1 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  30.99 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  30.16 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  28.06 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  34.29 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  33.1 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  33.72 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  25.97 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.17 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.47 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.47 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  26.98 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.47 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.47 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.15 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.74 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  34.75 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  32.68 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.7 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  35.57 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  32.68 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  32.68 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  35.1 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  32.35 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.47 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  27.88 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.72 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  27.23 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  30.34 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.37 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.37 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  29.38 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  33.55 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  32.28 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  37.06 
 
 
597 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.1 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.05 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  33.33 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  28.3 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.74 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  27.4 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28.9 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.41 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  35.97 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.61 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  33.1 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.87 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  29.51 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  25.68 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  25.68 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  35.54 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>