More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3619 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  682    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  63.05 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  48.63 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  45.07 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  39.4 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2449  hypothetical protein  37.46 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00490145  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  38.73 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  38.16 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  38.16 
 
 		 432 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  26.9 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  36.13 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  26.76 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  26.48 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  32.31 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  26.18 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.53 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  24.43 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  26.3 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  26.3 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  31.68 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.64 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  28.57 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  28.53 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  28.57 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  28.57 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  28.57 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  28.14 
 
 		 344 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  32.67 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  23.3 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  23.22 
 
 		 663 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  31.28 
 
 		 420 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  24.86 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  30.97 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  26.41 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  89.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  26.61 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  25.61 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  32.61 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  34.29 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  32.35 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3908  hypothetical protein  26.79 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  31.37 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  33.53 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  31.52 
 
 		 390 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  31.86 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  31.37 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  30.57 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  30.35 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  33.99 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  30.88 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  30.88 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  30.56 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  29.06 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  29.06 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  23.74 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  29.06 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  31.22 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  29.06 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  30.29 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  28.1 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  29.8 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  35.62 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  35.62 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  35.62 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  35.62 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  26.17 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  35.62 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  35.62 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  35.62 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  24.36 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  35.62 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  24.36 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  24.36 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  30.1 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  32.43 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  22.91 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  26.54 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  26 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1957  hypothetical protein  35.71 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654804  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  24.35 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  24.23 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  24.86 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  26.49 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  30 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  33.55 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  24.19 
 
 		 652 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  24.4 
 
 		 782 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  30 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  23.28 
 
 		 801 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  23.01 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  24.23 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  24.66 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>