More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  70.41 
 
 		 510 aa  714    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 		 503 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  69.01 
 
 		 500 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 		 503 aa  661    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  73.49 
 
 		 504 aa  762    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  62.85 
 
 		 512 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  68.7 
 
 		 495 aa  678    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 512 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  68.96 
 
 		 515 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  100 
 
 		 502 aa  1018    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 512 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 504 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  63.42 
 
 		 502 aa  628  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  63.51 
 
 		 507 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  63.13 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 501 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  61.19 
 
 		 565 aa  605  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 528 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  60.96 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 560 aa  590  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 516 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 499 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 500 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 		 499 aa  541  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 501 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 1113 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 1100 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 1094 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  49.69 
 
 		 1098 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 1101 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 1100 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 1138 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 1112 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 1112 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 1111 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 1120 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.01 
 
 		 1147 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 1172 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 647 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 504 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.22 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 573 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 507 aa  369  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 505 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 563 aa  363  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  39.06 
 
 		 771 aa  363  4e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 508 aa  362  6e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 516 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 583 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 514 aa  361  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 505 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 523 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 562 aa  360  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2270  lysyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 511 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 524 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 509 aa  359  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 501 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 561 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 508 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>