More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7190 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  100 
 
 
367 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5669  Band 7 protein  67.83 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.324788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2814  hypothetical protein  69.44 
 
 
339 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5534  SPFH domain / Band 7 family protein  72.63 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5083  Band 7 protein  70.53 
 
 
345 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33080  hypothetical protein  70.8 
 
 
337 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000208318  hitchhiker  0.00231515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  29.97 
 
 
318 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4126  HflC protein  29.45 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  29.02 
 
 
300 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  28.62 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  29.05 
 
 
308 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  27.68 
 
 
311 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  27.95 
 
 
300 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  27.61 
 
 
295 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  28.07 
 
 
281 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  27.59 
 
 
290 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  28.34 
 
 
299 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  24.41 
 
 
294 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  29.43 
 
 
283 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  28.08 
 
 
300 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  24.58 
 
 
293 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  28.38 
 
 
297 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  25.68 
 
 
292 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  26.53 
 
 
299 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  28.68 
 
 
283 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  28.66 
 
 
294 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  28.03 
 
 
281 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  28.53 
 
 
304 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  25.91 
 
 
292 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  25.96 
 
 
298 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  26.91 
 
 
292 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  23.49 
 
 
297 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  28.32 
 
 
282 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  27.7 
 
 
284 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  25.6 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  28.66 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  26.3 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3235  HflC protein  23.79 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000478035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  27.74 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  27.74 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  25.91 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  24.57 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002262  HflC protein  25.77 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00114995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  28.53 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2263  HflC protein  26.71 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  25 
 
 
292 aa  96.7  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  28.3 
 
 
282 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  28.25 
 
 
304 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  27.01 
 
 
283 aa  95.9  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  27.01 
 
 
283 aa  95.9  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  25.68 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  26.52 
 
 
284 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  29.19 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  26.88 
 
 
301 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  25.33 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  25.75 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  25.97 
 
 
302 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  27.92 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  26.81 
 
 
335 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0358  FtsH protease regulator HflC  24.46 
 
 
334 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  hitchhiker  0.00397927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  23.41 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  23.49 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  23.49 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3308  HflC protein  24.31 
 
 
292 aa  93.6  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  24.03 
 
 
289 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  22.49 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  29.35 
 
 
287 aa  93.2  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  29.47 
 
 
369 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  25.37 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  26.16 
 
 
308 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  25.37 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  25.37 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0549  membrane protease subunit HflC  25.25 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  26.43 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0578  FtsH protease regulator HflC  21.75 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  25.35 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  27.24 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  27.83 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  25.86 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00091  serine protease  24.05 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  25.98 
 
 
301 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  24.05 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  22.36 
 
 
331 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  23.76 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  26.33 
 
 
290 aa  89.7  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  29.3 
 
 
306 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2761  hflC protein  25.69 
 
 
326 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0386111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  26.32 
 
 
313 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2797  HflC protein  24.85 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0538  FtsH protease regulator HflC  22.6 
 
 
331 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0314  hflC protein, putative  24.49 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  25.96 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  23.18 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  28.37 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  28.57 
 
 
290 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  26.39 
 
 
295 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2774  HflC protein  23 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  26.89 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  28.57 
 
 
290 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>