207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5762 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  278  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  278  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  98.53 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  95.59 
 
 		 137 aa  266  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  97.06 
 
 		 137 aa  266  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  95.59 
 
 		 152 aa  265  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  84.56 
 
 		 137 aa  238  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  84.56 
 
 		 151 aa  238  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  84.56 
 
 		 137 aa  238  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  83.82 
 
 		 160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 141 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 141 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 141 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  83.82 
 
 		 137 aa  237  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  82.35 
 
 		 137 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  80.88 
 
 		 137 aa  227  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 160 aa  224  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 151 aa  173  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 169 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  60.29 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  61.9 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  61.29 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  62.9 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  51.59 
 
 		 277 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  46.72 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  40.96 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.41 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  37.84 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>