197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3899 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 435 aa  858    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  33.84 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  32.04 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  34.68 
 
 		 441 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.79 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  32.51 
 
 		 442 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  31.63 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 		 436 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.88 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 424 aa  180  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.89 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  29.61 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.23 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  30.98 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.87 
 
 		 438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 460 aa  144  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.94 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.94 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.18 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.12 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.36 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.34 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  24.8 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.81 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.28 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>