More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1996 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 670 aa  1330    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  57.05 
 
 		 714 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  56.2 
 
 		 606 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  49.93 
 
 		 620 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  48.56 
 
 		 684 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  47.58 
 
 		 585 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  45.39 
 
 		 640 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  47.65 
 
 		 661 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  53.86 
 
 		 585 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  44.58 
 
 		 581 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  58.44 
 
 		 635 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  44.28 
 
 		 584 aa  422  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  41.46 
 
 		 564 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  52.69 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  43.45 
 
 		 547 aa  365  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  39.12 
 
 		 603 aa  357  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  38.9 
 
 		 607 aa  347  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  46.25 
 
 		 674 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  35.36 
 
 		 666 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  49.31 
 
 		 605 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  36.98 
 
 		 632 aa  306  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  35.74 
 
 		 550 aa  290  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  43.45 
 
 		 680 aa  287  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  44.27 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 		 573 aa  278  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  36.04 
 
 		 538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  45.91 
 
 		 617 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  38.95 
 
 		 656 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  45.6 
 
 		 599 aa  247  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  36.75 
 
 		 653 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  47.48 
 
 		 649 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  44.27 
 
 		 598 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  44.27 
 
 		 598 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  44.27 
 
 		 598 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  38.75 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  35.33 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 		 533 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.63 
 
 		 532 aa  174  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.29 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.81 
 
 		 989 aa  171  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  35.6 
 
 		 533 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 533 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  28.57 
 
 		 531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  35.6 
 
 		 406 aa  163  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.21 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  37.59 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.87 
 
 		 900 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  40.61 
 
 		 855 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  34.58 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.23 
 
 		 849 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.31 
 
 		 977 aa  157  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  36.26 
 
 		 461 aa  154  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.86 
 
 		 532 aa  152  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  29.46 
 
 		 622 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.14 
 
 		 525 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  35.88 
 
 		 461 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  31.75 
 
 		 410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  37.88 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.41 
 
 		 403 aa  148  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.42 
 
 		 856 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  36.3 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  33.55 
 
 		 419 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  33.55 
 
 		 419 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  35.86 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  32.92 
 
 		 535 aa  146  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  34.63 
 
 		 441 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  36.3 
 
 		 489 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.18 
 
 		 839 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.82 
 
 		 856 aa  144  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  35.94 
 
 		 487 aa  144  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  26.89 
 
 		 619 aa  144  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.08 
 
 		 981 aa  143  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.85 
 
 		 530 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 495 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  32.65 
 
 		 445 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  33.55 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.27 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  34.96 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.79 
 
 		 735 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  35.71 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 		 474 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  32.13 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 		 515 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 537 aa  140  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  26.56 
 
 		 1029 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  33.56 
 
 		 595 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  30.03 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  33.59 
 
 		 470 aa  139  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  29.51 
 
 		 416 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  34.67 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.45 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.35 
 
 		 990 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  34.03 
 
 		 472 aa  138  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.79 
 
 		 531 aa  137  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  32.76 
 
 		 533 aa  137  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  36.76 
 
 		 470 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  36.76 
 
 		 470 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  32.87 
 
 		 551 aa  136  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>