202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0491 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  100 
 
 		 361 aa  722    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  70.79 
 
 		 354 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1675  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  68.93 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  62.89 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1486  DNA polymerase LigD polymerase subunit  58.61 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  59.26 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  54.76 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  53.28 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5867  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  53.76 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  52.82 
 
 		 334 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  55.33 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3665  hypothetical protein  54.52 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0652  DNA primase small subunit  56.15 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.0515309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  57.19 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  57.06 
 
 		 323 aa  352  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13762  hypothetical protein  52.44 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.798941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0821  DNA primase small subunit  52.59 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5542  hypothetical protein  50.72 
 
 		 349 aa  338  8e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.96 
 
 		 340 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1274  DNA primase, small subunit  50.43 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.558044  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  51.13 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  51.13 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  51.13 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4038  DNA primase small subunit  52.45 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  51.46 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3833  DNA primase small subunit  50 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0416  DNA primase small subunit  49.86 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  50.76 
 
 		 328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  49.55 
 
 		 329 aa  311  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  49.57 
 
 		 427 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2946  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  52.01 
 
 		 314 aa  302  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  47.15 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  47.71 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0664  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  46.95 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  44.75 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6628  DNA primase small subunit  47.84 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103402  hitchhiker  0.0000202322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5821  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.06 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  46.71 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  44.79 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  44.86 
 
 		 414 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  44.79 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  44.79 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  44.87 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10273  hypothetical protein  45.25 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0854972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  43.45 
 
 		 412 aa  249  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  35.64 
 
 		 312 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  34.48 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  30.61 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  28.67 
 
 		 303 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  33.76 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0817  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  36.96 
 
 		 522 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.138014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  28.81 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  29.53 
 
 		 896 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  33.56 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  35.62 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  32.96 
 
 		 861 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  30.62 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.56 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  32.79 
 
 		 871 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  32.89 
 
 		 877 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.33 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  32 
 
 		 872 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  31.37 
 
 		 766 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  32.98 
 
 		 865 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  32.3 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  28.37 
 
 		 646 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  28.47 
 
 		 855 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  32.99 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.08 
 
 		 778 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.42 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  31.16 
 
 		 763 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  33.77 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  33.33 
 
 		 813 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  33.67 
 
 		 878 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  34.84 
 
 		 293 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.42 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  26.89 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  31.9 
 
 		 847 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.61 
 
 		 797 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  30.69 
 
 		 815 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.01 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  32.14 
 
 		 656 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.21 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  27.42 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.03 
 
 		 902 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  32.67 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  32.96 
 
 		 818 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1301  hypothetical protein  30.94 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0366  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  26.78 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00411082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0258  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.77 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  31.65 
 
 		 304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  29.97 
 
 		 758 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  29.97 
 
 		 758 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  30.14 
 
 		 658 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  29.97 
 
 		 758 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  30.43 
 
 		 837 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1337  ATP dependent DNA ligase  31.71 
 
 		 868 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  29.64 
 
 		 847 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7647  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.08 
 
 		 544 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  30.9 
 
 		 846 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>