More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1786 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  50.85 
 
 		 240 aa  218  8.999999999999998e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  54.44 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  51.43 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 		 368 aa  101  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  50.49 
 
 		 391 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55.56 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  53.09 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  53.41 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.59 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  51.81 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 208 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 200 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 536 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.67 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.25 
 
 		 318 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 476 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 424 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 317 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  55.7 
 
 		 370 aa  86.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1785  cell wall-associated hydrolase  36.32 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.39 
 
 		 1048 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  50.59 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  45.54 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  46.46 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.05 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.83 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.5 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.43 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  48.24 
 
 		 524 aa  78.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  44.94 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.57 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  42.71 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  30.89 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  48.72 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  43.43 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.62 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  37.98 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  38.16 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 556 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  42.17 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  43.37 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 380 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  39.36 
 
 		 319 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  43 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.29 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  45.98 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  43 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  49.33 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.18 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  43.96 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.33 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.94 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  40.2 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  45.12 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  36.44 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 341 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 452 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  33.11 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  50 
 
 		 454 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>