More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5515 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1419    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 907 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 738 aa  198  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 713 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  27.29 
 
 		 717 aa  190  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 713 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 840 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 586 aa  184  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 465 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 850 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 503 aa  177  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 488 aa  177  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 499 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  35.35 
 
 		 488 aa  170  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  35.71 
 
 		 463 aa  169  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  35.71 
 
 		 463 aa  169  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 488 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 571 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 759 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  33.83 
 
 		 1202 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  35.45 
 
 		 1160 aa  158  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.73 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.64 
 
 		 1167 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 512 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 500 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  30.67 
 
 		 872 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 507 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  29.59 
 
 		 728 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 728 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 601 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 662 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.34 
 
 		 820 aa  144  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 339 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 1001 aa  140  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 		 733 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 588 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 897 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 639 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 571 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 304 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1124 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 481 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 409 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 1016 aa  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  31.38 
 
 		 1041 aa  127  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 635 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1002 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 482 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 489 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 582 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 631 aa  124  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 602 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  37.57 
 
 		 460 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7680  hypothetical protein  35.79 
 
 		 320 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 347 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0559  HWE histidine kinase  37.37 
 
 		 337 aa  120  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.690554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 346 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  39.23 
 
 		 505 aa  120  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.65 
 
 		 1190 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 929 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 446 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  31.82 
 
 		 655 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 677 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 341 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 358 aa  117  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  35.64 
 
 		 1027 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 632 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 655 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 559 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.35 
 
 		 1168 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  33.19 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 344 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 1132 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  29.79 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  30.8 
 
 		 1132 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  30.21 
 
 		 692 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3818  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 333 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.883776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.7 
 
 		 846 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 413 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 333 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 603 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 901 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  29.03 
 
 		 624 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>