145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0526 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  46.49 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  46.13 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  44.65 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  41.85 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  38.97 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  38.1 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  40.08 
 
 		 285 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  36.4 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  33.95 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  37.82 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  38.68 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  40.91 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  35.56 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  33.21 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  35.44 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  32.25 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  36.29 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  32.97 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  35.59 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  35.59 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  30.63 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  31 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  32.49 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  34 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.77 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  31.66 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  30.93 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.91 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  27.34 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  25.47 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  23.13 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  26.24 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  24.62 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  25.57 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.63 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  24.71 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  21.72 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  22.9 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  22.47 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  21.35 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  27.68 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  29.78 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  22.15 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  22.14 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  28.31 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  20.52 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.14 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  25.7 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  25.13 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  22.63 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  24.31 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  23.13 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  26.96 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  27.21 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4061  hypothetical protein  24.31 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  27.42 
 
 		 687 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  24.31 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  23.41 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  23.42 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  22.17 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  26.47 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  25.39 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  23.08 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  24.37 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  21.17 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  24.39 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  27.51 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  24.32 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  22.17 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  22.9 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.97 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  22.9 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  24.75 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  25.12 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  21.57 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  24.87 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  26.23 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  23.77 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  21.79 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  28.05 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  22.1 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  23.98 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  22.98 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.91 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  26.84 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  24 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  22.66 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  24.89 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  26.8 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  23.5 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  22.71 
 
 		 711 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  24.22 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  23.27 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  22.46 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  21.72 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  21.95 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>