98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31270 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31270  LmbE-like protein  100 
 
 		 245 aa  510  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1362  LmbE family protein  86.12 
 
 		 245 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.0409957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2092  LmbE family protein  84.02 
 
 		 247 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2515  hypothetical protein  87.24 
 
 		 258 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2028  LmbE family protein  87.24 
 
 		 244 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3203  LmbE family protein  86.83 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.628918  normal  0.0311865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0093  hypothetical protein  81.25 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4120  LmbE family protein  81.25 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0094  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  81.25 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0330  LmbE-like protein  83.88 
 
 		 246 aa  407  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0698342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4204  hypothetical protein  64.46 
 
 		 245 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.786164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1612  LmbE family protein  55.08 
 
 		 238 aa  261  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  51.44 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2678  LmbE family protein  46.64 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.545275  normal  0.0774255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4022  LmbE family protein  43.93 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0251604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0201  hypothetical protein  44.96 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  35.56 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.32 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  29.26 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  31.82 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.41 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  33.17 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  25.93 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  28.69 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  26.37 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  24.9 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  27.14 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  27.96 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  25.7 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  25.32 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  30.77 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  24.89 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.27 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  29.69 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  28.43 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 350 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  28.99 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2761  LmbE family protein  26.81 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  24.37 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  26.42 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  25.73 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  28.57 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  26.37 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  28.65 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  26.4 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.14 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  30.83 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.14 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  23.79 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.14 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  29.2 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.14 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.14 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  24.26 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.56 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  28.29 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  22.66 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  27.66 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  24.27 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.9 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.04 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  25.37 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  26.64 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.73 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  28.37 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  27.78 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  24.03 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.38 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.38 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  25.23 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  27.41 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  26.85 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  27.55 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  24.41 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  25.1 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  24.1 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  21.36 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  23.38 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  22.89 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  25.47 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  23.17 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  28.86 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  24.2 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.23 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  26.8 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  22.92 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  23.35 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  23.38 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  26.9 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  28.57 
 
 		 358 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.91 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  29.55 
 
 		 423 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  26.35 
 
 		 299 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.36 
 
 		 234 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  26.43 
 
 		 283 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  25.38 
 
 		 221 aa  42  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  26.7 
 
 		 218 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>