241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01790 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  73.33 
 
 
304 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  73.15 
 
 
314 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  75 
 
 
301 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  43.33 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  40.21 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  44.72 
 
 
308 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  44.72 
 
 
315 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  41.61 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  43.62 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  44.01 
 
 
305 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  44.74 
 
 
308 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  43.71 
 
 
336 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  41.29 
 
 
305 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  43.36 
 
 
310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  42.31 
 
 
339 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  41.25 
 
 
306 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  39.66 
 
 
297 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  46.1 
 
 
304 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  41.61 
 
 
302 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  42.66 
 
 
336 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  42.66 
 
 
336 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  43.93 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  38.16 
 
 
303 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  37.93 
 
 
350 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  36.91 
 
 
310 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  43.38 
 
 
311 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  40.4 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  36.3 
 
 
303 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  32.01 
 
 
306 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  43.82 
 
 
305 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  39.14 
 
 
307 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  40.34 
 
 
312 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  40.27 
 
 
330 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  37.46 
 
 
362 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  43.33 
 
 
308 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  42.31 
 
 
273 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  40.61 
 
 
299 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  32.57 
 
 
307 aa  148  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  40 
 
 
301 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  37.88 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  36.63 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  36.63 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  35.97 
 
 
308 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  36.27 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  39.72 
 
 
304 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  35.69 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  40 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  38.69 
 
 
304 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  39.34 
 
 
305 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  38.73 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  39.09 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  38.49 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  32.42 
 
 
316 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  28.16 
 
 
315 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  30.94 
 
 
318 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  30.94 
 
 
318 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  30.94 
 
 
318 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  30.94 
 
 
318 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  29.55 
 
 
316 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  31.56 
 
 
318 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 
315 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  31.91 
 
 
318 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  30.38 
 
 
316 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 
315 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  31.56 
 
 
318 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  30.22 
 
 
318 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  31.51 
 
 
313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  31.85 
 
 
313 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  31.74 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  29.43 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  28.91 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  29.41 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  31.4 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.93 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.8 
 
 
318 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.48 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.48 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  27.34 
 
 
318 aa  95.5  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.03 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.53 
 
 
318 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  31.02 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  34.01 
 
 
317 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  29.86 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  32.71 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.8 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  30.29 
 
 
319 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  30.43 
 
 
316 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  30.31 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.6 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  33.22 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  35.02 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  32.13 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  29.77 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  28.87 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  29.86 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  31.88 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>