207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0267 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  30.62 
 
 
185 aa  95.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  29.61 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  30.48 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1863  hypothetical protein  26.7 
 
 
176 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  28.65 
 
 
162 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.07 
 
 
170 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.93 
 
 
165 aa  55.5  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  39.77 
 
 
141 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  34.15 
 
 
162 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.15 
 
 
158 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  46.43 
 
 
165 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.08 
 
 
151 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.3 
 
 
152 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  44.64 
 
 
111 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 
147 aa  52.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.25 
 
 
144 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.33 
 
 
175 aa  52.4  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.89 
 
 
163 aa  52.4  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.07 
 
 
142 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.33 
 
 
165 aa  52.4  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.35 
 
 
168 aa  52  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48 
 
 
175 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.44 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.52 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  37.66 
 
 
172 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  38.98 
 
 
131 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  38.98 
 
 
131 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  38.46 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  38.46 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  47.06 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  27.63 
 
 
169 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.77 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  30.85 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  38.82 
 
 
178 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.81 
 
 
161 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.37 
 
 
148 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.06 
 
 
171 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  38.33 
 
 
133 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  47.27 
 
 
152 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  51.22 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  42 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.24 
 
 
156 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  31.52 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  46.94 
 
 
160 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  31.52 
 
 
144 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.93 
 
 
157 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  48.94 
 
 
179 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
157 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  44.44 
 
 
155 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  33.08 
 
 
164 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  29.59 
 
 
176 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  41.38 
 
 
176 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  41.38 
 
 
176 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  47.62 
 
 
163 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.24 
 
 
168 aa  48.5  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  44.9 
 
 
169 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 
171 aa  48.5  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  38.98 
 
 
163 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  50 
 
 
199 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  31.36 
 
 
179 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  36.9 
 
 
162 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.19 
 
 
156 aa  48.5  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.96 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  46 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  47.73 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  38.33 
 
 
133 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  45.24 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  37.5 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  36.84 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  37.7 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  36.84 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  43.75 
 
 
134 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.74 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  46 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  37.29 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.3 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  32.1 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  42.86 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  41.38 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.06 
 
 
166 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.17 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  38.1 
 
 
174 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  44.23 
 
 
140 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.34 
 
 
169 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  41.18 
 
 
179 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  52.27 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  45 
 
 
139 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  41.46 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>