More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3801 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3801  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 527 aa  1021    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289517  normal  0.106411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3673  ribosomal protein S1  81.82 
 
 		 408 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3814  RNA binding S1 domain protein  81.98 
 
 		 535 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3731  RNA binding S1 domain protein  81.73 
 
 		 537 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3269  30S ribosomal protein S1  37.19 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  37.19 
 
 		 400 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2939  30S ribosomal protein S1  35.85 
 
 		 403 aa  203  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2022  30S ribosomal protein S1  37.4 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000578746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2011  30S ribosomal protein S1  39.88 
 
 		 482 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  35.66 
 
 		 401 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0546  RNA binding S1 domain protein  38.25 
 
 		 410 aa  193  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1200  30S ribosomal protein S1  35.77 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000802868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  35.47 
 
 		 579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  34.46 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2122  30S ribosomal protein S1  36.18 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000709036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  33.24 
 
 		 573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  32.41 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1610  30S ribosomal protein S1  36.55 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  33.13 
 
 		 608 aa  170  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  33.59 
 
 		 491 aa  169  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  35.96 
 
 		 573 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  33.43 
 
 		 604 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  33.93 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  35.29 
 
 		 490 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.25 
 
 		 677 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  36 
 
 		 654 aa  167  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.67 
 
 		 676 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  32.35 
 
 		 575 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  31.87 
 
 		 558 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 564 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  34.35 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  34.35 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  34.35 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  32.04 
 
 		 562 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  31.87 
 
 		 558 aa  163  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 570 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 564 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  34.11 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  31.6 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  33.89 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  32.04 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  30.68 
 
 		 687 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  31.86 
 
 		 561 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  32.6 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  34.88 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  31.08 
 
 		 589 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  34.36 
 
 		 584 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  31.08 
 
 		 571 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  31.08 
 
 		 577 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  32.57 
 
 		 678 aa  160  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  31.18 
 
 		 560 aa  160  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  30.7 
 
 		 609 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  34.84 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  31.46 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  34.35 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  36.55 
 
 		 555 aa  159  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  36.55 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  33.83 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  35.25 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  32.6 
 
 		 573 aa  158  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  34.09 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  33.79 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.8 
 
 		 672 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  32.49 
 
 		 570 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  35.22 
 
 		 574 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  32.18 
 
 		 561 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  34.17 
 
 		 481 aa  156  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  34.71 
 
 		 408 aa  156  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  34.63 
 
 		 495 aa  156  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  31.22 
 
 		 561 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  32.13 
 
 		 569 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  32.13 
 
 		 569 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  33.42 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  31.55 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  35.06 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  31.55 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  33.59 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  32.65 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  33.59 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  30.49 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  34.12 
 
 		 584 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>