More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1324 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
400 aa  804    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  75.07 
 
 
402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  74.33 
 
 
402 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  74.33 
 
 
402 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2397  protein-export membrane protein SecF  33.08 
 
 
433 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  0.614956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  35.36 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  34.66 
 
 
404 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  44.17 
 
 
307 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  35.77 
 
 
314 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  34.07 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  33.8 
 
 
306 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.97 
 
 
762 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  32.78 
 
 
313 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.63 
 
 
759 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.56 
 
 
839 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  45.11 
 
 
337 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  45.11 
 
 
316 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  32.75 
 
 
372 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  34.45 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0345  preprotein translocase subunit SecF  30.63 
 
 
344 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  49.25 
 
 
316 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 
298 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  30.41 
 
 
356 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  32.97 
 
 
314 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0278  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 
344 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182784  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  38.53 
 
 
286 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  48.37 
 
 
312 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 
304 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 
304 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.73 
 
 
989 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  32.56 
 
 
357 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.28 
 
 
856 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.53 
 
 
846 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 
315 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 
315 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  32.68 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  30.35 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  36.76 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  42.19 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  42.19 
 
 
302 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.18 
 
 
844 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  40.29 
 
 
307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 
362 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 
302 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  32.19 
 
 
361 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  43.33 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  41.71 
 
 
315 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  29.6 
 
 
302 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  35.25 
 
 
359 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  35.36 
 
 
315 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  47.37 
 
 
313 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  38.21 
 
 
304 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
323 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  35.25 
 
 
307 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  47.37 
 
 
313 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.24 
 
 
853 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  43.09 
 
 
311 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  41.67 
 
 
327 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  35.92 
 
 
310 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  43.59 
 
 
308 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 
323 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  47.34 
 
 
322 aa  159  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 
323 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  43.93 
 
 
303 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  43.68 
 
 
314 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  49.7 
 
 
315 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  43.93 
 
 
324 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 
323 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  49.43 
 
 
856 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  45.51 
 
 
315 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  34 
 
 
305 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  34 
 
 
305 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  38.52 
 
 
315 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  43.35 
 
 
324 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 
315 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  41.92 
 
 
319 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  40.19 
 
 
325 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  36.19 
 
 
315 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.94 
 
 
846 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  39.06 
 
 
315 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  46.02 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  43.35 
 
 
303 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  36.5 
 
 
315 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  38.28 
 
 
315 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  38.67 
 
 
315 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
323 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
323 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  38.67 
 
 
315 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  38.67 
 
 
315 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.2 
 
 
302 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.78 
 
 
844 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.32 
 
 
351 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  38.04 
 
 
316 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  39.9 
 
 
322 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  37.21 
 
 
740 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  45.66 
 
 
302 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  33.21 
 
 
310 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  32.89 
 
 
320 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.52 
 
 
844 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>