More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1238 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 351 aa  711    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  48.82 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  47.92 
 
 		 361 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  51.02 
 
 		 356 aa  308  8e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  48.13 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  48.84 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1928  preprotein translocase subunit SecF  43.36 
 
 		 367 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  44.71 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  38.03 
 
 		 311 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35 
 
 		 302 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  38.25 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  35.69 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.12 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  36.12 
 
 		 304 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.85 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  33.43 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  33.63 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.65 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  33.63 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  33.64 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.06 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  32.35 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  32.84 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  34.12 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  35.34 
 
 		 302 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  33.14 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  32.84 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  36.98 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  33.73 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  32.68 
 
 		 302 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  33.05 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  34.13 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  34.48 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 306 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  33.13 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  33.13 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  36.76 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  32.63 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  30.72 
 
 		 759 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  32.36 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  37.5 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 		 308 aa  179  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  31.44 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  32.65 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  32.95 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  31.32 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  32.93 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.5 
 
 		 846 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  35.85 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.81 
 
 		 762 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  32.48 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.16 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  33.91 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  33.71 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.53 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  33.53 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  31.92 
 
 		 309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  32.16 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  32.1 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  34.76 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  31.87 
 
 		 735 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  32.63 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  33.63 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  33.74 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  32.42 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  33.08 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  32.09 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  30.35 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  33.14 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  34.75 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.11 
 
 		 1055 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  32.71 
 
 		 292 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  31.25 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  33.24 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  31.76 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  32.85 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  34.88 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  32.36 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  33.53 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  31.73 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  30.17 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  32.5 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.09 
 
 		 991 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  34.5 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  33.94 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.2 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  32.42 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.43 
 
 		 856 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>