More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3197 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  51.35 
 
 		 2376 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.82 
 
 		 2126 aa  1479    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  49.29 
 
 		 3711 aa  1165    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  100 
 
 		 4575 aa  8663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  48.52 
 
 		 4151 aa  2526    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  43.81 
 
 		 4882 aa  1343    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  47.31 
 
 		 7210 aa  1474    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  55.98 
 
 		 1143 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  44.08 
 
 		 7279 aa  1291    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.01 
 
 		 3033 aa  939    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.75 
 
 		 2719 aa  1479    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.05 
 
 		 2066 aa  1033    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 		 3874 aa  1974    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  46.05 
 
 		 3463 aa  1413    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.04 
 
 		 4840 aa  1314    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  41.34 
 
 		 2220 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.84 
 
 		 2024 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.22 
 
 		 3176 aa  895    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.96 
 
 		 1126 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  48.07 
 
 		 2108 aa  1528    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 1874 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  48.84 
 
 		 2020 aa  1514    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 		 3645 aa  717    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.63 
 
 		 1101 aa  799    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 		 2232 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  57.48 
 
 		 3148 aa  1121    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  37.62 
 
 		 5526 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  40.47 
 
 		 1827 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.76 
 
 		 6768 aa  2588    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.23 
 
 		 3158 aa  1028    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.56 
 
 		 2230 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.76 
 
 		 3254 aa  892    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  41.96 
 
 		 1616 aa  905    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.23 
 
 		 3493 aa  964    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  46.76 
 
 		 2081 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  50.19 
 
 		 2846 aa  1003    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  47.57 
 
 		 2060 aa  1307    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  50.99 
 
 		 1831 aa  1098    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  46.45 
 
 		 2367 aa  946    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 		 1559 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  49.14 
 
 		 3670 aa  1360    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 		 3693 aa  765    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.88 
 
 		 3449 aa  1052    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.31 
 
 		 3930 aa  1634    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  51.89 
 
 		 1114 aa  825    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.81 
 
 		 4264 aa  901    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  41.93 
 
 		 3427 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  47.48 
 
 		 1955 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.13 
 
 		 2333 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  49.63 
 
 		 2090 aa  918    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 		 4930 aa  1197    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  41.85 
 
 		 3508 aa  1162    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.11 
 
 		 2078 aa  951    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  51.91 
 
 		 1789 aa  1094    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  50.97 
 
 		 2374 aa  811    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  47.68 
 
 		 4080 aa  1249    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.73 
 
 		 4478 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  49.69 
 
 		 4607 aa  1433    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 1837 aa  986    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 		 3693 aa  765    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.35 
 
 		 4183 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.78 
 
 		 1867 aa  1050    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  42.71 
 
 		 3045 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  49.83 
 
 		 1077 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  48.84 
 
 		 1820 aa  1008    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.01 
 
 		 3676 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 		 1816 aa  1211    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.28 
 
 		 3696 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 		 7110 aa  1523    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  41.15 
 
 		 1805 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  39.49 
 
 		 3281 aa  1002    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.66 
 
 		 2107 aa  1009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  54.54 
 
 		 2966 aa  1045    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  44.43 
 
 		 3494 aa  1286    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.69 
 
 		 1602 aa  1093    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 		 3092 aa  1008    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  57.22 
 
 		 1584 aa  864    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  56.45 
 
 		 1601 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 		 5400 aa  1452    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.21 
 
 		 1559 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  48.46 
 
 		 4111 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  69.39 
 
 		 1593 aa  1032    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 		 3702 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.61 
 
 		 2890 aa  697    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.59 
 
 		 2847 aa  1110    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  49.13 
 
 		 1573 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  52.6 
 
 		 1548 aa  795    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  45.73 
 
 		 2113 aa  1044    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  49.56 
 
 		 5154 aa  1172    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  58.97 
 
 		 3355 aa  1210    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.76 
 
 		 3679 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  44.76 
 
 		 5255 aa  1281    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 2880 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  41.41 
 
 		 1806 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.95 
 
 		 1305 aa  765    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  53.02 
 
 		 3408 aa  1136    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  43.71 
 
 		 2277 aa  1055    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  44.89 
 
 		 1924 aa  1022    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.56 
 
 		 1822 aa  637  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.69 
 
 		 1939 aa  637  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>