More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0196 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  260  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  64.44 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 135 aa  173  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  58.52 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  60.74 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  58.52 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  42.65 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  48.89 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  40.46 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  40.6 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  37.06 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  39.47 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  39.47 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.56 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  41.51 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.34 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.82 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.82 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  36.57 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  35.65 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  37.68 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  32.82 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  37.72 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  40.57 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  34.65 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>