127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4018 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  52.56 
 
 		 1381 aa  1417    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  50.1 
 
 		 1441 aa  1330    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  98.49 
 
 		 1378 aa  758    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  62.44 
 
 		 1425 aa  1638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  52.11 
 
 		 1379 aa  1376    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  100 
 
 		 1418 aa  2786    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  55.39 
 
 		 1420 aa  1397    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  50.82 
 
 		 1394 aa  1283    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  43.7 
 
 		 1472 aa  990    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  51.04 
 
 		 1384 aa  1333    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1426 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  32.04 
 
 		 1426 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1426 aa  579  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1419 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1430 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1419 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1399 aa  515  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1399 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1397 aa  499  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1397 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1397 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1397 aa  499  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1372 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1398 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1368 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1398 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1397 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1397 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  33.54 
 
 		 1450 aa  412  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  23.44 
 
 		 1384 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1307 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1398 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1341 aa  341  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.44 
 
 		 1379 aa  329  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1284 aa  297  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1428 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1399 aa  296  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1399 aa  296  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1399 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1264 aa  271  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1261 aa  241  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1276 aa  213  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1307 aa  211  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1307 aa  208  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1305 aa  208  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1269 aa  202  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1266 aa  201  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1266 aa  199  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1266 aa  199  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1266 aa  198  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1266 aa  198  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  22.11 
 
 		 1301 aa  194  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.97 
 
 		 1304 aa  191  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1266 aa  188  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1265 aa  182  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1266 aa  181  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1266 aa  181  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1266 aa  180  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1266 aa  180  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  21.83 
 
 		 1266 aa  179  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1266 aa  179  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  21.44 
 
 		 1266 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1266 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1266 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 1300 aa  173  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1443 aa  167  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  22.59 
 
 		 1515 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1271 aa  163  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1273 aa  152  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1265 aa  151  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1271 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1271 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1276 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1271 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1419 aa  146  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1275 aa  145  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1291 aa  144  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1439 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1273 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1273 aa  142  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1392 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1446 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1459 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1454 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1267 aa  136  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  25 
 
 		 1441 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1416 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1417 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1436 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1383 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1390 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1309 aa  129  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1417 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1288 aa  128  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1283 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1274 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1306 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1286 aa  122  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1291 aa  120  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1287 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>