62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3884 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  89.82 
 
 		 657 aa  946    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  100 
 
 		 667 aa  1310    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 315 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 327 aa  88.2  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  22.27 
 
 		 529 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  24.66 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  19.16 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  19.07 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  25.1 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  23.1 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  23.68 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 		 330 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 		 316 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  17.75 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  23.18 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  26.54 
 
 		 291 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  37.5 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  29.82 
 
 		 275 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  23.83 
 
 		 301 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  28.89 
 
 		 275 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 891 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  24 
 
 		 523 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  25.53 
 
 		 523 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  47.06 
 
 		 627 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  32.63 
 
 		 682 aa  51.2  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 785 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  24.32 
 
 		 523 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 278 aa  51.2  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  23.04 
 
 		 282 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 282 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0647  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 306 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.562263  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  45.1 
 
 		 627 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 		 282 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  45.1 
 
 		 627 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  27.12 
 
 		 281 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  31.2 
 
 		 633 aa  47.8  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  25.32 
 
 		 282 aa  48.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  28.7 
 
 		 624 aa  47.8  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.5 
 
 		 277 aa  47.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  23.18 
 
 		 266 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3376  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 271 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 287 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 294 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.47 
 
 		 173 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  30.89 
 
 		 316 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 274 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 459 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 426 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  28.47 
 
 		 288 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 406 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 830 aa  44.3  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  26.25 
 
 		 286 aa  43.9  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.48 
 
 		 274 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>