182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3224 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 615 aa  1214    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.85 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  27.39 
 
 		 758 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  25.12 
 
 		 623 aa  160  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  23.53 
 
 		 650 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  29.22 
 
 		 613 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.65 
 
 		 695 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  29.46 
 
 		 594 aa  140  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  27.02 
 
 		 553 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.54 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.15 
 
 		 596 aa  127  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  28.24 
 
 		 594 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  26.82 
 
 		 682 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  23.94 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  23.76 
 
 		 703 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.48 
 
 		 637 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  23.41 
 
 		 712 aa  98.2  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 574 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.74 
 
 		 652 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.92 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  28.94 
 
 		 807 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.52 
 
 		 780 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.39 
 
 		 714 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.42 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.32 
 
 		 689 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.93 
 
 		 793 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.28 
 
 		 762 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  23.89 
 
 		 728 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  29.28 
 
 		 691 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  21.4 
 
 		 569 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  21.4 
 
 		 569 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.42 
 
 		 647 aa  70.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  31.47 
 
 		 784 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.02 
 
 		 669 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.17 
 
 		 773 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.56 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.56 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.66 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  28.24 
 
 		 769 aa  67  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.49 
 
 		 685 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.93 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  32.07 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  26.54 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  27.18 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  19.92 
 
 		 674 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  24.22 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.64 
 
 		 639 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  20.74 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  50 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  27.47 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  44.64 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.89 
 
 		 607 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  20.74 
 
 		 773 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  33.02 
 
 		 666 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  20.06 
 
 		 688 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  36.11 
 
 		 374 aa  55.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  31.65 
 
 		 380 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  31.65 
 
 		 380 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  31.94 
 
 		 373 aa  54.3  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.89 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  42.86 
 
 		 384 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  27.52 
 
 		 744 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  36.92 
 
 		 372 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  21.86 
 
 		 659 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.68 
 
 		 615 aa  51.6  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  21.28 
 
 		 537 aa  51.2  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  23.43 
 
 		 598 aa  51.2  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  28.57 
 
 		 494 aa  50.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  48.94 
 
 		 377 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 374 aa  50.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  42.5 
 
 		 374 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.13 
 
 		 653 aa  50.4  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  41.07 
 
 		 371 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  42.5 
 
 		 374 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  43.86 
 
 		 1185 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  32.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  24.31 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  21.05 
 
 		 586 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.62 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  30.56 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1179 aa  50.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.44 
 
 		 397 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  32.1 
 
 		 1082 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  23.76 
 
 		 508 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  35.53 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  37.33 
 
 		 374 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  34.25 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.06 
 
 		 374 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1174 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  39.06 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  34.26 
 
 		 388 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  37.35 
 
 		 363 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  44.68 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>