More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2727 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  36.94 
 
 		 1241 aa  765    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  50.13 
 
 		 1201 aa  1091    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  53.59 
 
 		 1231 aa  768    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  54.03 
 
 		 1203 aa  1213    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  53.36 
 
 		 1209 aa  1224    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  52.53 
 
 		 1226 aa  1201    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  51.79 
 
 		 1197 aa  1140    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  49.29 
 
 		 1204 aa  1106    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  57.23 
 
 		 1205 aa  1238    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  50.17 
 
 		 1204 aa  1078    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  41.98 
 
 		 1822 aa  962    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  55.41 
 
 		 1488 aa  804    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  49.55 
 
 		 1209 aa  1091    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  55.49 
 
 		 1201 aa  1196    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  55.57 
 
 		 1233 aa  1225    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  56.12 
 
 		 1238 aa  739    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  53.69 
 
 		 1205 aa  1102    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  53.11 
 
 		 1210 aa  1226    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  57.48 
 
 		 1205 aa  1239    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  61.02 
 
 		 1179 aa  1380    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  57.25 
 
 		 1203 aa  1269    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  50.66 
 
 		 1212 aa  973    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  55.27 
 
 		 1203 aa  1243    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  50.37 
 
 		 1206 aa  1204    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  54.92 
 
 		 1204 aa  1248    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  53.87 
 
 		 1212 aa  1244    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  53.77 
 
 		 1205 aa  1105    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.57 
 
 		 1220 aa  1107    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  52.48 
 
 		 1197 aa  1176    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  49.29 
 
 		 1207 aa  1085    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  54.42 
 
 		 1200 aa  1217    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  63.8 
 
 		 1176 aa  1389    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  61.71 
 
 		 1243 aa  884    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  63.2 
 
 		 1176 aa  1381    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  49.67 
 
 		 1209 aa  1148    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  53.26 
 
 		 1200 aa  1203    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  100 
 
 		 1162 aa  2297    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  61.3 
 
 		 1183 aa  1380    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  57.83 
 
 		 1205 aa  1251    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  60.46 
 
 		 1183 aa  1371    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  46.8 
 
 		 1208 aa  1061    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  54.02 
 
 		 1208 aa  1237    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  49 
 
 		 1204 aa  1094    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  63.7 
 
 		 1179 aa  1365    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  53.51 
 
 		 1201 aa  1206    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  60.74 
 
 		 1180 aa  1333    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  57.48 
 
 		 1205 aa  1239    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  53.69 
 
 		 1205 aa  1102    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  52.82 
 
 		 677 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  53.05 
 
 		 663 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  60.41 
 
 		 1172 aa  1367    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  61.42 
 
 		 1182 aa  1399    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  60.63 
 
 		 1179 aa  1361    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  57.88 
 
 		 1205 aa  1308    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  54.31 
 
 		 1228 aa  1212    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  50.94 
 
 		 1234 aa  1071    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.3 
 
 		 1204 aa  1056    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.72 
 
 		 447 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.38 
 
 		 446 aa  379  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1318  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50 
 
 		 668 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  47.4 
 
 		 666 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.66 
 
 		 450 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1736  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  49.44 
 
 		 671 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.124901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  44.65 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1404  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.45 
 
 		 733 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000354677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1379  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.92 
 
 		 453 aa  366  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.98 
 
 		 666 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.59 
 
 		 448 aa  366  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.71 
 
 		 752 aa  366  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4535  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.1 
 
 		 662 aa  364  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2191  propionyl-CoA carboxylase alpha subunit  46.98 
 
 		 695 aa  364  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2467  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  42.7 
 
 		 649 aa  363  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30197  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2316  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.85 
 
 		 662 aa  363  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459588  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1096  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.58 
 
 		 453 aa  363  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.78 
 
 		 670 aa  363  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3585  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.99 
 
 		 671 aa  363  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.930093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  45.89 
 
 		 686 aa  362  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.88 
 
 		 670 aa  362  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1039  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.37 
 
 		 447 aa  361  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.08 
 
 		 449 aa  361  5e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.21 
 
 		 448 aa  361  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.95 
 
 		 449 aa  361  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  45.45 
 
 		 681 aa  360  6e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1660  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.95 
 
 		 445 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.29 
 
 		 671 aa  360  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.54 
 
 		 449 aa  360  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  43.14 
 
 		 654 aa  360  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  47.63 
 
 		 654 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0029  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.04 
 
 		 450 aa  359  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00270537  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.77 
 
 		 447 aa  358  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.65 
 
 		 667 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.76 
 
 		 666 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.54 
 
 		 447 aa  358  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0153  pyruvate carboxylase subunit A  48.54 
 
 		 518 aa  358  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27286  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0164  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  47.39 
 
 		 662 aa  358  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0218805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2736  biotin carboxylase/biotin-containing subunit  42.27 
 
 		 649 aa  358  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  44.02 
 
 		 654 aa  357  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1874  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.31 
 
 		 669 aa  358  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.53 
 
 		 445 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.53 
 
 		 450 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>