155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0794 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 647 aa  1305    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.92 
 
 		 640 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.47 
 
 		 594 aa  117  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  27 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  29.41 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  35.94 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  32.84 
 
 		 554 aa  79.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  27.39 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  36.03 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  34.23 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  34.23 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  34.23 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  34.38 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  34.23 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  34.23 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  35.46 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  35.46 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  35.46 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  34.13 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  34.13 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  32.09 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  35.29 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  34.13 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  26.08 
 
 		 594 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  34.13 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  32.09 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  35.94 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.13 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  32.09 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  32.09 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.09 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  22.15 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.97 
 
 		 652 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.8 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  24.88 
 
 		 641 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.49 
 
 		 626 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  27.23 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  24.81 
 
 		 619 aa  70.1  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  26.82 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  25.87 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  23.63 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  33.59 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.1 
 
 		 608 aa  67.8  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  19.52 
 
 		 714 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  20.45 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.02 
 
 		 623 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  23.74 
 
 		 598 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.28 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  23.65 
 
 		 659 aa  63.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  22.34 
 
 		 598 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.12 
 
 		 688 aa  60.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  23.13 
 
 		 553 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.03 
 
 		 642 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  20.36 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.97 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.29 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.31 
 
 		 601 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  22.99 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  24.49 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.19 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  22.76 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  21.79 
 
 		 728 aa  57  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  33.7 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  24.51 
 
 		 626 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  22.04 
 
 		 670 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.99 
 
 		 616 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.35 
 
 		 595 aa  53.9  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  19.3 
 
 		 685 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  21.32 
 
 		 696 aa  52.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  43.4 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  38.98 
 
 		 365 aa  51.6  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  36.73 
 
 		 579 aa  52  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  36.08 
 
 		 403 aa  51.6  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0924  hypothetical protein  37.78 
 
 		 347 aa  51.2  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  38.36 
 
 		 818 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  29.35 
 
 		 513 aa  50.8  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.9 
 
 		 605 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  40 
 
 		 362 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  50 
 
 		 409 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  44.19 
 
 		 397 aa  50.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  46.51 
 
 		 380 aa  50.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  22.88 
 
 		 439 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  22.48 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.86 
 
 		 607 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.21 
 
 		 613 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  29.35 
 
 		 628 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  39.71 
 
 		 376 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  32.41 
 
 		 584 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  22.03 
 
 		 707 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  37.31 
 
 		 604 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.82 
 
 		 689 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.63 
 
 		 674 aa  48.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  22.71 
 
 		 378 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  35.94 
 
 		 347 aa  47.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.67 
 
 		 603 aa  47.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 591 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  46.94 
 
 		 79 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.18 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  38.78 
 
 		 356 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>