94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0883 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  158  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  45.33 
 
 
430 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  35.23 
 
 
406 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.72 
 
 
437 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  44.19 
 
 
359 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 
1191 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  47.73 
 
 
421 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  35.62 
 
 
439 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.94 
 
 
647 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  41.94 
 
 
422 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  41.94 
 
 
423 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  36.73 
 
 
762 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  48.08 
 
 
399 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  46.34 
 
 
393 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  38 
 
 
427 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  48.78 
 
 
398 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  37.7 
 
 
564 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  39.29 
 
 
422 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  46.67 
 
 
581 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  43.86 
 
 
818 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  46.34 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  37.7 
 
 
385 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  39.58 
 
 
773 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  40 
 
 
1189 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1189 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  33.78 
 
 
478 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1189 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  46.34 
 
 
399 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  40.74 
 
 
403 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.67 
 
 
376 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  29.73 
 
 
394 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  37.04 
 
 
442 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  40 
 
 
365 aa  44.3  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  43.1 
 
 
452 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.58 
 
 
365 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.5 
 
 
634 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  34.48 
 
 
454 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  51.06 
 
 
405 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  41.67 
 
 
650 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  41.03 
 
 
417 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  36.96 
 
 
782 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0105  SMC domain protein  48.08 
 
 
543 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  38.33 
 
 
377 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  41.86 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  40.43 
 
 
341 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  47.73 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  34.88 
 
 
371 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  39.02 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  34.38 
 
 
382 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  32 
 
 
423 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  51.35 
 
 
410 aa  42  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.36 
 
 
377 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  34.43 
 
 
410 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  34.38 
 
 
382 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  45.45 
 
 
340 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  46 
 
 
424 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  33.77 
 
 
653 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  37.78 
 
 
1189 aa  41.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  37.04 
 
 
1074 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  34.38 
 
 
440 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  34.78 
 
 
533 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.19 
 
 
397 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  38 
 
 
361 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  37.21 
 
 
369 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  37.21 
 
 
370 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  46.81 
 
 
598 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  38 
 
 
361 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  37.21 
 
 
370 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 
377 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  46.81 
 
 
598 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  33.33 
 
 
382 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  33.33 
 
 
382 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  34.78 
 
 
595 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1722  SMC domain-containing protein  38.3 
 
 
580 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198567  hitchhiker  0.0000514519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  40.43 
 
 
987 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.53 
 
 
386 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  39.66 
 
 
346 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  36.59 
 
 
395 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  43.48 
 
 
522 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.36 
 
 
379 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  45.45 
 
 
687 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  37.5 
 
 
376 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
362 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1194  DNA repair protein RecN  41.46 
 
 
507 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  36.59 
 
 
395 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  40.74 
 
 
352 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  37.21 
 
 
371 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  43.14 
 
 
527 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  30.38 
 
 
852 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.36 
 
 
391 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  41.46 
 
 
394 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  36.96 
 
 
374 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  45 
 
 
411 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>