79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4194 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
515 aa  1053    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
739 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.13 
 
 
816 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.08 
 
 
632 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
637 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
583 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
909 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
808 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.82 
 
 
422 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
762 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
1486 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.28 
 
 
810 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
927 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
750 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  30 
 
 
1078 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.7 
 
 
725 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.54 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.46 
 
 
837 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
566 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
3145 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
224 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.02 
 
 
865 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
1827 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.29 
 
 
1078 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
685 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
681 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  23.97 
 
 
603 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  25.6 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 
734 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  28.7 
 
 
529 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
878 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.25 
 
 
863 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  27.7 
 
 
185 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.21 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.88 
 
 
964 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  30 
 
 
1079 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  31.09 
 
 
185 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
227 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  25.13 
 
 
395 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 
565 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  29.57 
 
 
929 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.97 
 
 
1737 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
3172 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  27.5 
 
 
780 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.53 
 
 
560 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
217 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2449  hypothetical protein  23.51 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
3301 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
750 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
1061 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  21.6 
 
 
764 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25 
 
 
622 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 
564 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 
293 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  28.43 
 
 
530 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
1180 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4030  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.85 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.033541  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
612 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
828 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
565 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.73 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 
385 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  32.38 
 
 
235 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  26.76 
 
 
297 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47959  predicted protein  24.69 
 
 
463 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  31.25 
 
 
545 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
448 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.5 
 
 
564 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
533 aa  43.9  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
1596 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
448 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
288 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  31.58 
 
 
181 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
317 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 
329 aa  43.5  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
362 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>