244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3615 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3615  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 353 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242924  normal  0.313882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1794  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 250 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.218592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.61 
 
 		 581 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 		 1056 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 		 1056 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.65 
 
 		 818 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1276 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 988 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 4079 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23 
 
 		 820 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 4489 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 		 1022 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 955 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  25.52 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 3560 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 707 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3941  TPR repeat-containing protein  19.43 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.79 
 
 		 247 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1421 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.74 
 
 		 560 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.48 
 
 		 730 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.1 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 602 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  31.87 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 750 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 935 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.7 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 637 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 883 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 761 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.12 
 
 		 1979 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 3035 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 156 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 		 248 aa  50.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1827 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 		 519 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 156 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 608 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.76 
 
 		 715 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 927 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 615 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 601 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 236 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.88 
 
 		 864 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 156 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  22.93 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 		 1154 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  26.37 
 
 		 653 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 653 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 713 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1866  von Willebrand factor, type A  25.47 
 
 		 628 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.86 
 
 		 739 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.23 
 
 		 1694 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0672  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 192 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 2262 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 		 784 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.23 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  28.7 
 
 		 784 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.12 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 		 199 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.69 
 
 		 839 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 558 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 450 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  27.13 
 
 		 656 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  26.58 
 
 		 490 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 827 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 486 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 662 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1454  hypothetical protein  29.81 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.72 
 
 		 745 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 635 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 667 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>