176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1794 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1794  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
250 aa  516  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.218592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3615  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
353 aa  158  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242924  normal  0.313882 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
4079 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
1276 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
1069 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.06 
 
 
988 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.45 
 
 
1056 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 
818 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  27.16 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  28.8 
 
 
385 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 
1694 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.69 
 
 
730 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1192 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 
1022 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.65 
 
 
784 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 
1056 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.4 
 
 
707 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.23 
 
 
784 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
601 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
236 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.87 
 
 
564 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  34.07 
 
 
622 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
375 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
927 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 
542 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 
836 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25 
 
 
462 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.79 
 
 
668 aa  50.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
804 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
3560 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
591 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
602 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
391 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.35 
 
 
750 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
649 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 
632 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
562 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
377 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
211 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.13 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
3035 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
4489 aa  48.9  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
392 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  30.53 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.32 
 
 
745 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
1180 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  27.87 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
605 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
1094 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
593 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  24.1 
 
 
375 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 
1979 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
269 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
286 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.18 
 
 
504 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
343 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
301 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.21 
 
 
682 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
474 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
699 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  24.72 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
592 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
523 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
450 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
565 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  28.21 
 
 
415 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
344 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.14 
 
 
560 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
747 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
290 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  25.95 
 
 
309 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
187 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 
778 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
409 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  31.18 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
1737 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  28.02 
 
 
864 aa  45.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.68 
 
 
626 aa  45.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  27.03 
 
 
527 aa  45.4  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
329 aa  45.4  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
399 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
425 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
574 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.01 
 
 
576 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
486 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.56 
 
 
839 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.78 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.28 
 
 
1007 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>