96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2551 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  100 
 
 
647 aa  1292    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  35.91 
 
 
690 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  32.78 
 
 
662 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 
514 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.69 
 
 
499 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 
499 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
495 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 
486 aa  101  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 
495 aa  97.8  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 
514 aa  97.4  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  24.51 
 
 
508 aa  97.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 
559 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 
491 aa  94.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 
490 aa  92.8  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  26.43 
 
 
509 aa  90.9  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  25.41 
 
 
522 aa  90.9  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  29.55 
 
 
506 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  26.57 
 
 
507 aa  85.9  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 
528 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  29.7 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
587 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  23.48 
 
 
510 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 
486 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  22.46 
 
 
542 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.49 
 
 
459 aa  65.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  22.46 
 
 
542 aa  65.1  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  23.92 
 
 
493 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 
436 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  21.29 
 
 
762 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  23.54 
 
 
731 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  24.66 
 
 
577 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  22.79 
 
 
493 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 
461 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
590 aa  57.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.59 
 
 
470 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1970  integral outer membrane protein TolC, efflux pump component  24.07 
 
 
487 aa  57  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000188791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  20.73 
 
 
537 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 
471 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 
462 aa  53.5  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 
497 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.83 
 
 
486 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 
463 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.9 
 
 
470 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 
427 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.57 
 
 
486 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3202  hypothetical protein  26.58 
 
 
223 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.87 
 
 
463 aa  50.8  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  23.55 
 
 
462 aa  50.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 
685 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.83 
 
 
452 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 
508 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  26.39 
 
 
452 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.57 
 
 
452 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.93 
 
 
477 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 
469 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 
486 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.06 
 
 
477 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 
460 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 
535 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1403  Outer membrane protein-like protein  22.51 
 
 
506 aa  47.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.438484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 
451 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  21.77 
 
 
492 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.73 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.51 
 
 
449 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  23.73 
 
 
491 aa  47.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
453 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  27.44 
 
 
443 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.21 
 
 
525 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  22.78 
 
 
617 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  21.96 
 
 
504 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  21.77 
 
 
492 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.69 
 
 
517 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.79 
 
 
484 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  24.49 
 
 
443 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  22.36 
 
 
496 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.26 
 
 
492 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 
496 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 
471 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.4 
 
 
513 aa  45.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  25.59 
 
 
487 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  22.8 
 
 
517 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.05 
 
 
479 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.13 
 
 
472 aa  44.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.78 
 
 
478 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 
433 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2158  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
467 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00293127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 
427 aa  43.9  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.46 
 
 
461 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 
1496 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>