10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1403 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1403  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 506 aa  1023    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.438484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 495 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 528 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0075  putative outer membrane component of multidrug efflux  20.99 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0947347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 647 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1970  integral outer membrane protein TolC, efflux pump component  20 
 
 		 487 aa  43.5  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000188791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>