262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2299 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2299  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 333 aa  687    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3941  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1866  von Willebrand factor, type A  28.27 
 
 		 628 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 3145 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 878 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.37 
 
 		 810 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.57 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1005 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.26 
 
 		 1034 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.88 
 
 		 863 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 762 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 808 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.13 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.74 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.21 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.95 
 
 		 622 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  28.18 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.11 
 
 		 550 aa  56.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 609 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 870 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.59 
 
 		 837 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 1252 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 718 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 3301 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 3172 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  27.39 
 
 		 566 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 634 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  26.04 
 
 		 233 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 594 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  27.43 
 
 		 1004 aa  53.1  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 767 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3086  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 254 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 542 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 697 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.56 
 
 		 1764 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.04 
 
 		 733 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.01 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 689 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.38 
 
 		 764 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 739 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 605 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 942 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 708 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.26 
 
 		 875 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28 
 
 		 581 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 105 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 909 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 542 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.81 
 
 		 880 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  30.77 
 
 		 936 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.48 
 
 		 577 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 750 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.92 
 
 		 561 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 824 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 209 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1406 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.92 
 
 		 1077 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 607 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.52 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 789 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 		 473 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 108 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1127 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  33.64 
 
 		 681 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 817 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 1022 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.71 
 
 		 565 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 613 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  36.76 
 
 		 104 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1096 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.42 
 
 		 887 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 811 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1178 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.84 
 
 		 577 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  25.29 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 4079 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 1213 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.61 
 
 		 706 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  27.89 
 
 		 1124 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>