211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2305 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  59.45 
 
 		 1023 aa  921    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  100 
 
 		 1025 aa  1964    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  38.51 
 
 		 989 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  30.34 
 
 		 1018 aa  320  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  28.52 
 
 		 1018 aa  296  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  25.65 
 
 		 1029 aa  293  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  25.6 
 
 		 1029 aa  292  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  25.55 
 
 		 1029 aa  292  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25.85 
 
 		 1029 aa  292  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  25.55 
 
 		 1029 aa  292  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.66 
 
 		 1029 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.64 
 
 		 1029 aa  290  9e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  23.64 
 
 		 1009 aa  262  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  55.3 
 
 		 881 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  25.35 
 
 		 1033 aa  229  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  53.89 
 
 		 995 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  40.51 
 
 		 986 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  49.09 
 
 		 1291 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  38.52 
 
 		 962 aa  211  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  52.58 
 
 		 1249 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  62.64 
 
 		 986 aa  199  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  27.38 
 
 		 1029 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.12 
 
 		 1020 aa  191  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  31.8 
 
 		 1020 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  32.09 
 
 		 1018 aa  187  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  29.31 
 
 		 1029 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.88 
 
 		 1030 aa  184  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  52.85 
 
 		 1191 aa  182  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  56.82 
 
 		 1009 aa  179  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  26.4 
 
 		 1029 aa  179  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  47.81 
 
 		 1058 aa  179  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.31 
 
 		 1029 aa  179  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  40.87 
 
 		 1017 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  33.01 
 
 		 953 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32.65 
 
 		 1018 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32.22 
 
 		 1018 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.22 
 
 		 1018 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32.22 
 
 		 1018 aa  174  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  28.18 
 
 		 1049 aa  170  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  50.56 
 
 		 1013 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  51.74 
 
 		 1047 aa  163  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  40.7 
 
 		 1018 aa  163  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  53.98 
 
 		 995 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  52.27 
 
 		 1046 aa  161  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  38.29 
 
 		 1020 aa  160  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  48.59 
 
 		 1018 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  36.69 
 
 		 1018 aa  160  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  40.93 
 
 		 1018 aa  158  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  48.02 
 
 		 1039 aa  156  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  48.02 
 
 		 1018 aa  153  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  48.02 
 
 		 1018 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  37.6 
 
 		 1081 aa  151  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  39.13 
 
 		 1018 aa  151  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  49.14 
 
 		 1022 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  54.88 
 
 		 1006 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  42.61 
 
 		 1009 aa  147  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  42.61 
 
 		 1009 aa  147  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  38.66 
 
 		 1038 aa  142  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  37.68 
 
 		 1018 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  26.43 
 
 		 1085 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  41.45 
 
 		 1046 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.06 
 
 		 906 aa  123  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  27.58 
 
 		 1091 aa  122  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  38.58 
 
 		 1011 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  39.33 
 
 		 1059 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  45.51 
 
 		 1024 aa  118  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  28.14 
 
 		 1213 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  31.88 
 
 		 1223 aa  114  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  35.06 
 
 		 810 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  30.82 
 
 		 1219 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  39.55 
 
 		 1307 aa  112  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  40 
 
 		 1303 aa  111  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  36.51 
 
 		 1165 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  42.07 
 
 		 1226 aa  111  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  50.35 
 
 		 1101 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  40.22 
 
 		 1234 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  32.54 
 
 		 1247 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  35.38 
 
 		 904 aa  109  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  35.27 
 
 		 1164 aa  109  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  42.75 
 
 		 1224 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  33.74 
 
 		 1223 aa  108  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  33.49 
 
 		 1308 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  31.25 
 
 		 1048 aa  106  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  31.25 
 
 		 1047 aa  106  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  38.1 
 
 		 1346 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  31.25 
 
 		 1048 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  46.97 
 
 		 1214 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  31.25 
 
 		 1047 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1048 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  31.25 
 
 		 1047 aa  106  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  31.25 
 
 		 1047 aa  106  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  31.25 
 
 		 1047 aa  106  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  50.86 
 
 		 1214 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.36 
 
 		 1230 aa  105  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  46.97 
 
 		 1214 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  43.36 
 
 		 1088 aa  105  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  35 
 
 		 1223 aa  105  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  30.58 
 
 		 1047 aa  105  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  46.97 
 
 		 1214 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  50.86 
 
 		 1214 aa  104  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>