More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1157 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 400 aa  774    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  64.35 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  58.12 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  58.41 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  58.62 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  57.63 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 		 906 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  46.53 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  44.2 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  52.03 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.54 
 
 		 541 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.6 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  49.5 
 
 		 290 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 331 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.66 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  40.77 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  44.07 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  43.9 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  43.9 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  34.64 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  33.7 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  33.7 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  33.7 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  35.97 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  39.58 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  41.43 
 
 		 844 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  35.26 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.53 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  32.71 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  37.31 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.52 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.48 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  41.23 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  32 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.56 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  37.5 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.55 
 
 		 662 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  35.22 
 
 		 352 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.77 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  37.74 
 
 		 682 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  36.3 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  39.39 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  36.3 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  36.3 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  35.82 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  40.48 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  40.48 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.84 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2285  transglycosylase domain-containing protein  36.17 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  35.71 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000590482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  33.1 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  37.18 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  36.17 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.62 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  46.05 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.3 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  31.58 
 
 		 241 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.1 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004084  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.62 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.26 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  30.94 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.62 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.07 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  50 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  49.09 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  53.06 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  52.73 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  48.15 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.52 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  48.15 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  32.62 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  32.61 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  43.66 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  39.58 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3179  murein hydrolase B  48.15 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  41.86 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  55.77 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  55.77 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  46.27 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  50.79 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  58 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  58 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  30.28 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  58 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  58 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  51.02 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  58 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  58 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  45.45 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  45.45 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>