299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2431 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
379 aa  751    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  74.87 
 
 
375 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  74.6 
 
 
375 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  64.46 
 
 
384 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  59.63 
 
 
378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  59.63 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  60.95 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  60.7 
 
 
375 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  60.05 
 
 
373 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  58.12 
 
 
385 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  55.05 
 
 
381 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  55.88 
 
 
386 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  52.67 
 
 
375 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  52.27 
 
 
375 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  54.5 
 
 
389 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  51.6 
 
 
375 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
383 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 
381 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 
374 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 
367 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
361 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  41.29 
 
 
368 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 
368 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  41.18 
 
 
368 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
357 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
376 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
382 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.89 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
806 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.99 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  23.06 
 
 
476 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
496 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  24.64 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  24.28 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
806 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  28.33 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 
405 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
385 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 
378 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
389 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 
806 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
823 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
815 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
492 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 
479 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 
799 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
815 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.02 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  23.42 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  28.43 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  22.19 
 
 
503 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
843 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 
478 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  24.56 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.11 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  26.71 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
802 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  24.58 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  24.58 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  21.98 
 
 
478 aa  56.6  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
390 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>