More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0121 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.5 
 
 
206 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  47.69 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.77 
 
 
210 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  48.68 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.85 
 
 
210 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.56 
 
 
210 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  48.31 
 
 
210 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  47.37 
 
 
210 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.8 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.01 
 
 
219 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  47.17 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  45.78 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  40.48 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  49 
 
 
688 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.34 
 
 
210 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.34 
 
 
207 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  47.09 
 
 
213 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  48.51 
 
 
216 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.89 
 
 
210 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  51.1 
 
 
217 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  50.24 
 
 
221 aa  167  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.87 
 
 
210 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  48.02 
 
 
703 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  47.4 
 
 
217 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  49.75 
 
 
688 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  49.75 
 
 
705 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  42.86 
 
 
211 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  44.23 
 
 
214 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  46.57 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  48.11 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  51.11 
 
 
226 aa  165  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  49.47 
 
 
214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.29 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  43.87 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  45.93 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  45.41 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.26 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.89 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  48.31 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  47.76 
 
 
686 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  39.51 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  47.37 
 
 
225 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  38.54 
 
 
213 aa  162  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  43.4 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  45.67 
 
 
210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  43.54 
 
 
214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  47.14 
 
 
213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  42.58 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  46.89 
 
 
206 aa  161  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.67 
 
 
210 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  40.29 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  43.33 
 
 
226 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  40.09 
 
 
222 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  43.48 
 
 
211 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.33 
 
 
203 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.23 
 
 
205 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  40.69 
 
 
209 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  45.79 
 
 
213 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.15 
 
 
213 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.29 
 
 
212 aa  158  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.2 
 
 
212 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.72 
 
 
707 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  43.69 
 
 
224 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  48.22 
 
 
244 aa  157  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  39.62 
 
 
211 aa  157  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  44.39 
 
 
209 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  43.94 
 
 
210 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  47.06 
 
 
244 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  49.23 
 
 
240 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  45.54 
 
 
208 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45.28 
 
 
206 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  46.41 
 
 
206 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  48.29 
 
 
210 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.06 
 
 
234 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  38.83 
 
 
213 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40.28 
 
 
219 aa  155  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  46.04 
 
 
901 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.1 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.72 
 
 
205 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  44.76 
 
 
220 aa  154  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  46.15 
 
 
203 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  42.52 
 
 
209 aa  154  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.13 
 
 
208 aa  154  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43 
 
 
226 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  37.44 
 
 
212 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  46.08 
 
 
204 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  41.55 
 
 
236 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.36 
 
 
216 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  49.02 
 
 
215 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  48.48 
 
 
219 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  43.65 
 
 
197 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  45.23 
 
 
686 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  42.99 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  44.62 
 
 
295 aa  152  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  39.52 
 
 
199 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  48.26 
 
 
662 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  45.85 
 
 
204 aa  151  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.06 
 
 
202 aa  151  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.16 
 
 
197 aa  151  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>