More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00818 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00818  tRNA-dihydrouridine synthase 3 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BF62]  100 
 
 		 714 aa  1489    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83606  dihydrouridine synthase of tRNA  43.13 
 
 		 613 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.85826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00050  tRNA dihydrouridine synthase, putative  36.02 
 
 		 725 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13664  predicted protein  36.07 
 
 		 545 aa  340  7e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86070  predicted protein  33.83 
 
 		 608 aa  332  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_1214  predicted protein  39.6 
 
 		 361 aa  276  9e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4121  predicted protein  34.78 
 
 		 287 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.381062 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0210  tRNA-dihydrouridine synthase B  27.51 
 
 		 308 aa  117  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2343  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.48 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00690  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  28.67 
 
 		 333 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0018  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.1 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0937  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.36 
 
 		 307 aa  109  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0758  putative tRNA-dihydrouridine synthase  26.63 
 
 		 317 aa  108  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.164456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1077  nitrogen regulation protein Nifr3  27.44 
 
 		 333 aa  108  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00730813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  28.81 
 
 		 322 aa  108  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0661  TIM-barrel protein, nifR3 family  29.41 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.618567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2070  nifR3 family TIM-barrel protein  29.18 
 
 		 349 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0124103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2083  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.09 
 
 		 328 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0914  nifR3 family TIM-barrel protein  27.55 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106236  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1169  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  26.91 
 
 		 318 aa  105  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2996  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.82 
 
 		 329 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1363  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  26.71 
 
 		 328 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0154  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.98 
 
 		 351 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.386223  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_004310  BR1119  nitrogen regulation protein Nifr3  27.24 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.919164  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16990  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  30 
 
 		 415 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.56447  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0025  NifR3 family protein  26.67 
 
 		 320 aa  103  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0316  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  25.43 
 
 		 317 aa  103  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.932941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2392  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.53 
 
 		 329 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2861  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.82 
 
 		 333 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0021  NifR3 family TIM-barrel protein  29.15 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3365  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  27.33 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815066  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0479  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.05 
 
 		 327 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0020045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2236  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.86 
 
 		 347 aa  102  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1530  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.57 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.85935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  26.57 
 
 		 326 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2469  putative dihydrouridine synthase  26.57 
 
 		 326 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1074  nifR3 family TIM-barrel protein  26.69 
 
 		 332 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1528  dihydrouridine synthase DuS  26.27 
 
 		 301 aa  101  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000383307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2942  TIM-barrel protein, nifR3 family  27.97 
 
 		 320 aa  101  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0360  NifR3 family TIM-barrel protein  28.28 
 
 		 329 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2561  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  27.78 
 
 		 324 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5809  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.96 
 
 		 345 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0243889 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0136  tRNA-dihydrouridine synthase B  23.96 
 
 		 308 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0158  tRNA-dihydrouridine synthase B  24.26 
 
 		 305 aa  98.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.116258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6205  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545793  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0247  tRNA-dihydrouridine synthase B  25.37 
 
 		 306 aa  99  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0273  nifR3 family TIM-barrel protein  25.26 
 
 		 347 aa  98.2  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4974  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.91 
 
 		 398 aa  98.6  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0373  putative tRNA-dihydrouridine synthase  24.64 
 
 		 331 aa  98.2  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3665  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.18 
 
 		 337 aa  98.2  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4068  putative tRNA-dihydrouridine synthase (nitrogen regulation protein nifR3)  28.99 
 
 		 317 aa  98.2  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1617  TIM-barrel protein, nifR3 family  25.98 
 
 		 315 aa  97.8  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03215  putative TIM-barrel enzyme, possible dehydrogenase  25.08 
 
 		 330 aa  97.4  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1691  TIM-barrel protein, nifR3 family  25.52 
 
 		 333 aa  97.8  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0118  tRNA-dihydrouridine synthase B  23.96 
 
 		 308 aa  97.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0565  tRNA-dihydrouridine synthase B  25.97 
 
 		 327 aa  96.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000409979  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6005  TIM-barrel protein, nifR3 family  27.46 
 
 		 348 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2884  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein NifR3  28.03 
 
 		 354 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.423298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1088  nifR3 family TIM-barrel protein  26.6 
 
 		 337 aa  96.3  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3131  nifR3 family TIM-barrel protein  28.45 
 
 		 341 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187121  normal  0.248814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3077  nifR3 family TIM-barrel protein  25 
 
 		 329 aa  96.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06240  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  28.01 
 
 		 436 aa  95.9  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0091  dihydrouridine synthase DuS  24.91 
 
 		 305 aa  95.5  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0403  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.57 
 
 		 358 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2788  TIM-barrel protein, nifR3 family  25.3 
 
 		 325 aa  95.1  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00335838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0637  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.71 
 
 		 331 aa  95.1  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.299268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1813  nifR3 family TIM-barrel protein  27.27 
 
 		 352 aa  95.1  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_002620  TC0013  NifR3/Smm1 family protein  25.51 
 
 		 334 aa  94.7  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0231  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 		 325 aa  94.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1403  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.65 
 
 		 321 aa  94.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03937  tRNA-dihydrouridine synthase B  27.59 
 
 		 332 aa  94.7  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259416  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2456  dihydrouridine synthase  28.92 
 
 		 350 aa  94.4  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2807  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.65 
 
 		 321 aa  94.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0818  hypothetical protein  27.22 
 
 		 327 aa  94  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.540115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0425  NifR3 family TIM-barrel protein  26.99 
 
 		 324 aa  93.6  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1810  TIM-barrel protein, nifR3 family  25.27 
 
 		 338 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752321  hitchhiker  0.00592071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2132  nitrogen regulation protein  27.3 
 
 		 332 aa  93.6  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1005  dihydrouridine synthase family protein  26.86 
 
 		 325 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0279  tRNA-dihydrouridine synthase  26.28 
 
 		 335 aa  93.2  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.690235  hitchhiker  0.007193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3699  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.91 
 
 		 321 aa  92.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  26.8 
 
 		 319 aa  92.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2184  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.04 
 
 		 346 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.067096  normal  0.397805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13830  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  27.24 
 
 		 406 aa  92.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0110  nifR3 family TIM-barrel protein  27.46 
 
 		 318 aa  92.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000348489  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0800  TIM-barrel protein, nifR3 family  27.34 
 
 		 363 aa  91.7  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.873611  normal  0.99103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1464  nifR3 family TIM-barrel protein  27.84 
 
 		 362 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00679382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0429  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.37 
 
 		 381 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  0.096876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1620  nifR3 family TIM-barrel protein  28.77 
 
 		 354 aa  92  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0382  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.91 
 
 		 355 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4131  nifR3 family TIM-barrel protein  26.13 
 
 		 349 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0397  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.91 
 
 		 355 aa  91.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10310  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  25.96 
 
 		 341 aa  91.7  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.193475  unclonable  0.00000000180311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2731  NifR3 family TIM-barrel protein  24.76 
 
 		 333 aa  91.3  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00411092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0506  NIFR3-like protein  27.43 
 
 		 356 aa  91.3  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973131  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0550  NifR3/Smm1 family protein  27.87 
 
 		 338 aa  91.3  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000498133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2032  nifR3 family TIM-barrel protein  26.03 
 
 		 353 aa  91.3  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0351  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.76 
 
 		 343 aa  91.3  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.175072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6811  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.9 
 
 		 393 aa  90.9  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1443  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  27.8 
 
 		 349 aa  90.9  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.915684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2866  nifR3 family TIM-barrel protein  29.07 
 
 		 326 aa  90.5  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000362833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>